More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2114 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 268 aa  517  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  68.66 
 
 		 268 aa  361  9e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  50.75 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  45.21 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  48.51 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 		 264 aa  201  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.35 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  44.89 
 
 		 233 aa  116  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  33.84 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  39.53 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  38.75 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  28.68 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  32.31 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  39.18 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  35.17 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  48.21 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  49.54 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  31.66 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  45.54 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  31.46 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  31.92 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  31.92 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  48.18 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  29.85 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  47.27 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  31.92 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  46.91 
 
 		 339 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  51.69 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  49.04 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  31 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  45.97 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  46.3 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.77 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.74 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  35.03 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  51.75 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  48.28 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  48.28 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  50.46 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  31.27 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  31.27 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  31.27 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  35.03 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  31.27 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  48.12 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  35.44 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  41.51 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 		 475 aa  102  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  40.65 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  30.41 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.16 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  40.12 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  32.71 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  45.53 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  46.53 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  32.03 
 
 		 267 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.54 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  42.37 
 
 		 712 aa  99  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  43.64 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  43.75 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  49.54 
 
 		 291 aa  99  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  30.54 
 
 		 307 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  31.64 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.25 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  48.78 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 		 306 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  48.18 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  48.78 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  40.76 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  37.45 
 
 		 282 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  48.78 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  46.9 
 
 		 285 aa  95.9  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 		 285 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  46.9 
 
 		 285 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  46.9 
 
 		 285 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  46.9 
 
 		 285 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>