More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1386 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
270 aa  531  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  95.56 
 
 
270 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  50.19 
 
 
270 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1500  phosphatidate cytidylyltransferase  46.18 
 
 
285 aa  224  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  40.22 
 
 
281 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  37.28 
 
 
281 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.09 
 
 
281 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  36.31 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  42.95 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  41.96 
 
 
282 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  42.07 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  29.58 
 
 
296 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  47.2 
 
 
270 aa  109  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  47.52 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  29.96 
 
 
276 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  33.7 
 
 
264 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
269 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  38.07 
 
 
306 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 
310 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  41.36 
 
 
265 aa  106  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  37.27 
 
 
261 aa  106  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 
261 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  41.35 
 
 
341 aa  105  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
263 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  38.81 
 
 
264 aa  105  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  36.32 
 
 
269 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 
253 aa  105  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  37.71 
 
 
277 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 
254 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  39.06 
 
 
264 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  36.47 
 
 
260 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 
261 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  30.07 
 
 
280 aa  103  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  36.05 
 
 
306 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  38.06 
 
 
260 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  36.61 
 
 
233 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 
263 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  31.4 
 
 
275 aa  102  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  27.72 
 
 
307 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  29.93 
 
 
259 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  36.72 
 
 
279 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  31.84 
 
 
271 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 
284 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 
266 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  32.34 
 
 
272 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 
285 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
264 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  31.27 
 
 
275 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 
252 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
268 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 
278 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  29.57 
 
 
328 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 
296 aa  99.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  38.22 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  43.08 
 
 
268 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  29.09 
 
 
277 aa  99.4  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  34 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  33.54 
 
 
264 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  38.78 
 
 
264 aa  99  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
255 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  36.05 
 
 
280 aa  99.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 
269 aa  99  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  38.28 
 
 
286 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
263 aa  99  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
263 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 
281 aa  98.6  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
263 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
246 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  34.15 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  30.45 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  32.37 
 
 
295 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  31.14 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  32.84 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  30.65 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  29.96 
 
 
280 aa  96.3  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  31.87 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1107  phosphatidate cytidylyltransferase  31.28 
 
 
236 aa  96.7  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 
475 aa  96.3  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  28.52 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  30.63 
 
 
274 aa  95.9  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  39.71 
 
 
285 aa  95.9  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.2 
 
 
236 aa  95.9  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>