More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1535 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
294 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  81.82 
 
 
281 aa  328  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  55.19 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  53.02 
 
 
286 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  55.32 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  55.91 
 
 
286 aa  211  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  41.01 
 
 
296 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  45.85 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 
278 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  43.43 
 
 
270 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  40.53 
 
 
282 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  43.54 
 
 
280 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 
276 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  36.74 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  41.54 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  40.73 
 
 
282 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  42.19 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  44.22 
 
 
270 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  37.28 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 
282 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  38.08 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  38.32 
 
 
280 aa  122  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  37.94 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  37.06 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  39.77 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  41.51 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  47.29 
 
 
221 aa  113  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  43.9 
 
 
216 aa  112  6e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  37.28 
 
 
288 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  45.24 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  49.18 
 
 
268 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  48.48 
 
 
273 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  48.48 
 
 
273 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  50.63 
 
 
285 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  30.23 
 
 
270 aa  105  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  27.41 
 
 
269 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 
264 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  53.49 
 
 
229 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 
263 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  38.81 
 
 
280 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  27.02 
 
 
280 aa  103  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  31.94 
 
 
270 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 
263 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  45.95 
 
 
264 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 
263 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  47.97 
 
 
265 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  35.39 
 
 
287 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 
273 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  32.93 
 
 
279 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  41.5 
 
 
281 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 
281 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  43.55 
 
 
265 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 
341 aa  100  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 
281 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
211 aa  100  4e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 
208 aa  99.8  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.17 
 
 
205 aa  99.4  7e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  45.31 
 
 
280 aa  99  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  46.85 
 
 
264 aa  99  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  32.57 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  46.48 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  35.8 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  45.39 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  38.97 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  46.48 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
259 aa  96.7  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  48.18 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  43.59 
 
 
284 aa  95.9  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  36.93 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  35.05 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3996  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 
284 aa  96.3  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428683  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  35.04 
 
 
277 aa  95.9  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  44.04 
 
 
264 aa  95.9  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  44.04 
 
 
267 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  35.47 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  40.5 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  39.43 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  41.04 
 
 
271 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
233 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  32.26 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  30.39 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  36.42 
 
 
287 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 
273 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  41.27 
 
 
264 aa  94  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  45.71 
 
 
271 aa  93.2  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  45.16 
 
 
273 aa  92.8  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  41.01 
 
 
285 aa  93.2  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  50.42 
 
 
271 aa  92.8  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
262 aa  92.8  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  46.34 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  47.83 
 
 
271 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>