More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3724 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
281 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  98.93 
 
 
281 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  96.07 
 
 
281 aa  504  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  74.91 
 
 
277 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  41.9 
 
 
280 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  39.72 
 
 
252 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
280 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  32.73 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  36 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  47.55 
 
 
282 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  49.61 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  35.56 
 
 
280 aa  133  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  38.05 
 
 
296 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  46.56 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  50.39 
 
 
279 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  36.4 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  36.8 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  36.65 
 
 
281 aa  129  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  37.92 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  34.94 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  41.49 
 
 
233 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  47.4 
 
 
271 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  46.53 
 
 
341 aa  123  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  32.36 
 
 
270 aa  123  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  43.21 
 
 
271 aa  123  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
263 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  35.82 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  45.93 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  31.54 
 
 
281 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  46.94 
 
 
267 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  49.62 
 
 
242 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
263 aa  118  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
263 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
263 aa  118  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  46.31 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  36.09 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  47.58 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  32.11 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  46.03 
 
 
265 aa  117  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 
283 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.46 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  30.11 
 
 
270 aa  115  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  41.56 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1490  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661926 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  48.09 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  32.75 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2751  phosphatidate cytidylyltransferase  41.08 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  36.88 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
259 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.55 
 
 
475 aa  113  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  32.21 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
285 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  37.11 
 
 
272 aa  112  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  37.11 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 
255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  32.02 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  41.89 
 
 
259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  32.83 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
322 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  33.94 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 
263 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  46.88 
 
 
260 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  46.88 
 
 
260 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  31.34 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  36.96 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  47.29 
 
 
276 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 
285 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  39.73 
 
 
287 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 
285 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 
285 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
274 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 
285 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 
285 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  50.81 
 
 
262 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 
282 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 
262 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 
261 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 
282 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  48.78 
 
 
285 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.63 
 
 
285 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  49.56 
 
 
306 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 
282 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  47.97 
 
 
285 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  45.31 
 
 
268 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 
277 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>