More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1277 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
267 aa  527  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  43.98 
 
 
268 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  41.04 
 
 
271 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
271 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 
271 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  44.4 
 
 
271 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  45.17 
 
 
267 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  44.03 
 
 
271 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  44.03 
 
 
271 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  44.03 
 
 
271 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  43.66 
 
 
271 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  40.79 
 
 
281 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  42.01 
 
 
285 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.21 
 
 
285 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  39.36 
 
 
285 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  39.36 
 
 
285 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  37.01 
 
 
282 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  37.01 
 
 
282 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  37.01 
 
 
282 aa  168  8e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  38.08 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.08 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  38.08 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  38.08 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  39.57 
 
 
287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  38.08 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  38.08 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  38.46 
 
 
285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  38.08 
 
 
285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  38.43 
 
 
285 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  38.43 
 
 
285 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  38.43 
 
 
285 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.43 
 
 
285 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.43 
 
 
285 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  36.26 
 
 
280 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  37.37 
 
 
285 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  38.81 
 
 
282 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  36.17 
 
 
287 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  35.5 
 
 
268 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  35.5 
 
 
272 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  38 
 
 
256 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  34.75 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  40.16 
 
 
249 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  36 
 
 
280 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  37.94 
 
 
285 aa  149  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  36.82 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  37.1 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  35.61 
 
 
287 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  34.98 
 
 
285 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  34.75 
 
 
285 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  34.75 
 
 
285 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  34.4 
 
 
285 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  37.81 
 
 
285 aa  142  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  32.87 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  37.23 
 
 
285 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  37.23 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  33.22 
 
 
285 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  34.6 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2422  phosphatidate cytidylyltransferase  33.45 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  34.27 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  36.52 
 
 
285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  36.98 
 
 
275 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  32.51 
 
 
285 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  37.55 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  34.41 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  36.17 
 
 
290 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  34.88 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  35.46 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1687  putative phosphatidate cytidylyltransferase  35.36 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426329  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
276 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0325  phosphatidate cytidylyltransferase  34.88 
 
 
284 aa  128  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1461  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.152404  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  35.38 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  35.94 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  38.35 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  33.81 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5324  phosphatidate cytidylyltransferase  37.98 
 
 
273 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0966585  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2450  phosphatidate cytidylyltransferase  36.07 
 
 
273 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166236 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  34.98 
 
 
269 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  34.94 
 
 
273 aa  125  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  37.13 
 
 
273 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  33.94 
 
 
328 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  35 
 
 
269 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1916  phosphatidate cytidylyltransferase  37.98 
 
 
273 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  37.33 
 
 
281 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  36.64 
 
 
281 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  34.17 
 
 
273 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  38.02 
 
 
275 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  34.63 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  36.79 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  34.85 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  37.46 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  35.84 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1262  phosphatidate cytidylyltransferase  37.46 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  34.72 
 
 
265 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2047  phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  37.19 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>