More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1500 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1500  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  54.24 
 
 
270 aa  278  7e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  46.18 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  44.66 
 
 
270 aa  232  5e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  43.06 
 
 
281 aa  202  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  43.87 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  30.11 
 
 
341 aa  113  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  35.47 
 
 
281 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  34.76 
 
 
280 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  29.37 
 
 
280 aa  109  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  38.01 
 
 
267 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
267 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  38.01 
 
 
267 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 
272 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 
268 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  41.21 
 
 
258 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  34.88 
 
 
281 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.88 
 
 
281 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  33.19 
 
 
268 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  29.18 
 
 
310 aa  106  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  29.02 
 
 
296 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  43.26 
 
 
269 aa  105  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  33 
 
 
280 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 
260 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 
288 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.77 
 
 
368 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  29.95 
 
 
282 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
264 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  35.19 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
263 aa  99.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  37.76 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  30.28 
 
 
269 aa  99  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
246 aa  99  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  38.69 
 
 
264 aa  99  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.43 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  38.3 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  41.09 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  40.43 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  40.8 
 
 
306 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  39.72 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.52 
 
 
285 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  39.39 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  27.3 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  38.76 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  31.03 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  38.57 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  30.14 
 
 
342 aa  95.9  7e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
270 aa  95.9  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  36.03 
 
 
242 aa  95.9  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  33.93 
 
 
275 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  35.48 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  35.88 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  34.66 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  36.16 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  39.39 
 
 
267 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  38.73 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  34.19 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  32.56 
 
 
277 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  40.97 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  35.54 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  34.25 
 
 
307 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  31.9 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  42.24 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 
269 aa  92.8  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  33.12 
 
 
289 aa  92.8  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  35.07 
 
 
285 aa  92.4  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  36.75 
 
 
274 aa  92.4  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
255 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.16 
 
 
271 aa  92.4  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
265 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  39.23 
 
 
280 aa  92.4  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  34.87 
 
 
260 aa  92  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
285 aa  92  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  36.11 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  35.07 
 
 
285 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  39.17 
 
 
263 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>