More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12895 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  100 
 
 
306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  65.61 
 
 
292 aa  352  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  59.65 
 
 
292 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  61.05 
 
 
284 aa  331  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  60.7 
 
 
284 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  60.7 
 
 
284 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  53.54 
 
 
297 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  54.28 
 
 
296 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  48.84 
 
 
293 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
281 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  43.71 
 
 
348 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  46.93 
 
 
277 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  40.86 
 
 
276 aa  195  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  40.47 
 
 
339 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  42.21 
 
 
313 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  39.02 
 
 
301 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  37.42 
 
 
308 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 
441 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 
368 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  38.95 
 
 
281 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 
484 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  37.11 
 
 
311 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  40.07 
 
 
291 aa  169  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  34.15 
 
 
284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  38.36 
 
 
308 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  39.25 
 
 
352 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  35.08 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 
306 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  34.41 
 
 
289 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  35.25 
 
 
290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
280 aa  142  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  36.21 
 
 
302 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  35.14 
 
 
278 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.04 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  55.08 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  34.48 
 
 
280 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  33.66 
 
 
341 aa  108  9.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  28.12 
 
 
328 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  27 
 
 
343 aa  107  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  38.92 
 
 
269 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.45 
 
 
475 aa  102  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  38.69 
 
 
282 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  38.79 
 
 
264 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  41.67 
 
 
285 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  41.67 
 
 
285 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  41.67 
 
 
285 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.67 
 
 
285 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 
267 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.67 
 
 
285 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  42.25 
 
 
282 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  42.19 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  42.45 
 
 
285 aa  99  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  37.31 
 
 
260 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  45.53 
 
 
279 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.38 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  38.51 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  29.27 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  40.38 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  38.21 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  49.54 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  45.38 
 
 
280 aa  97.4  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  41.79 
 
 
242 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 
260 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  39.19 
 
 
233 aa  97.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  39.57 
 
 
282 aa  97.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  39.57 
 
 
282 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  39.57 
 
 
282 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 
260 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  38.97 
 
 
241 aa  96.3  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
263 aa  96.3  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.19 
 
 
285 aa  96.3  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  35.77 
 
 
280 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  37.41 
 
 
270 aa  95.9  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  28.03 
 
 
303 aa  95.5  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  47.32 
 
 
268 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  39.34 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  38.85 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  39.34 
 
 
272 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  38.03 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  38.13 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  36.69 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 
241 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  28.08 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 
287 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
267 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  48.62 
 
 
272 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>