More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4122 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
292 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  88.93 
 
 
284 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  89.29 
 
 
284 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  89.29 
 
 
284 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  76.71 
 
 
292 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  59.65 
 
 
306 aa  340  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  59.86 
 
 
297 aa  331  7.000000000000001e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  58.5 
 
 
296 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  51.88 
 
 
293 aa  289  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  51.45 
 
 
281 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 
348 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  45.39 
 
 
276 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  48.54 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  44.56 
 
 
339 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  47.87 
 
 
301 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  44.61 
 
 
287 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  47.74 
 
 
441 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  42.16 
 
 
313 aa  199  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  41.22 
 
 
284 aa  198  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  42.96 
 
 
281 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  43.12 
 
 
289 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 
368 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  41.58 
 
 
311 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  42.23 
 
 
308 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  45.99 
 
 
484 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  41.01 
 
 
308 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  37.7 
 
 
306 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  39.36 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  42.5 
 
 
291 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  41.11 
 
 
290 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 
302 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 
352 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 
403 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  41.24 
 
 
280 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  38.66 
 
 
278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  31.21 
 
 
343 aa  130  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  30.6 
 
 
328 aa  122  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  52.14 
 
 
291 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  51.38 
 
 
277 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  32.56 
 
 
280 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 
282 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.68 
 
 
475 aa  99.8  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  40.66 
 
 
271 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 
285 aa  99  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  45.16 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  39.88 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  32.21 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  39.31 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  36.31 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
307 aa  96.3  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  44.09 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  30.27 
 
 
267 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  30.65 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  45.71 
 
 
284 aa  94  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  41.35 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 
271 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
290 aa  94  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 
274 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  42.38 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
280 aa  93.6  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  37.68 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  42.37 
 
 
269 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 
272 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
296 aa  92.8  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
271 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  40.51 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  40.51 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  40.51 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  31.78 
 
 
280 aa  92.4  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  29.76 
 
 
275 aa  92.4  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  44.04 
 
 
268 aa  92  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  46.23 
 
 
269 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  31.87 
 
 
264 aa  92  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  38.14 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  31.47 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  32.57 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  41.74 
 
 
266 aa  90.9  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  40.32 
 
 
303 aa  89.7  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  32.86 
 
 
342 aa  90.1  4e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  38.75 
 
 
281 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  36.3 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 
279 aa  89  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0209  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 
247 aa  89  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.809934  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  38.32 
 
 
283 aa  89  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  37.23 
 
 
241 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  37.3 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  34.06 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 
267 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  39.44 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>