More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1419 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 287 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  52.63 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  53.79 
 
 		 348 aa  248  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  50.56 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  54.93 
 
 		 403 aa  239  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  47.89 
 
 		 293 aa  231  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  47.99 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  48.51 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  47.14 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  50.18 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  48.1 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  46.48 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  52.54 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  49.82 
 
 		 441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  43.73 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  46.01 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  50.73 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  42.19 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  45.68 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  42.6 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  42.6 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  42.6 
 
 		 284 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  48.36 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  45.8 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  45.13 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 		 352 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  41.18 
 
 		 306 aa  191  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  45.94 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  48.91 
 
 		 484 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  45.62 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  44.41 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  41.81 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  31.89 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  31.6 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  54.1 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  49.19 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  34.19 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  41.82 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.59 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  50.38 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  48.85 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  45.52 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  48.85 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  48.85 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  48.46 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  46.92 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  48.48 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  48.06 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  48.06 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  48.94 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  47.14 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  42.45 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  45.19 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  43.7 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  43.7 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  43.7 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  45.75 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  39.02 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  45.53 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  35.81 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  45.67 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  43.15 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  44.93 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.93 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.93 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  44.93 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  40.91 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  44.93 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  39.23 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 		 475 aa  98.6  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  44.22 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  45.16 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  34.44 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  41.98 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  30.95 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>