More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1946 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
266 aa  520  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  48.48 
 
 
264 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  41.42 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 
269 aa  193  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  48.51 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  39.11 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  30.66 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  32.22 
 
 
279 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  34.38 
 
 
260 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
276 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  38.08 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
264 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
264 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  33.67 
 
 
296 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  38.33 
 
 
277 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  32.72 
 
 
265 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.82 
 
 
233 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  32.3 
 
 
270 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
261 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  37.85 
 
 
712 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  30.5 
 
 
282 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
242 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  39.75 
 
 
262 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  32.45 
 
 
265 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
254 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  46.97 
 
 
339 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  32.3 
 
 
270 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 
273 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  31.2 
 
 
261 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  46.61 
 
 
260 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  32.19 
 
 
252 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  47.75 
 
 
263 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  48.65 
 
 
260 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  48.65 
 
 
260 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 
264 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 
266 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  44.92 
 
 
264 aa  102  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
260 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  47.75 
 
 
263 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  32.83 
 
 
271 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  40.69 
 
 
265 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  33.71 
 
 
268 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  34.92 
 
 
273 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
271 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  34.09 
 
 
271 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 
211 aa  99.4  5e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  38.36 
 
 
216 aa  99  6e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  32.69 
 
 
271 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 
290 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  48.18 
 
 
287 aa  98.6  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  45.76 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  44.88 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  43.48 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  46.61 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  43.08 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  40.46 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.22 
 
 
475 aa  97.1  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  33.06 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  32.38 
 
 
280 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  43.07 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  42.15 
 
 
289 aa  97.1  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  44.74 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  41.26 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  46.96 
 
 
280 aa  96.3  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  29.06 
 
 
271 aa  95.9  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  42.64 
 
 
301 aa  96.3  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 
292 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 
267 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  35.06 
 
 
280 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  45.61 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 
255 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  34.12 
 
 
276 aa  95.5  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 
311 aa  95.1  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.03 
 
 
368 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  45.53 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  32.33 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  43.08 
 
 
291 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 
294 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>