More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2395 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 277 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  68.95 
 
 		 277 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  42.38 
 
 		 712 aa  216  4e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  39.44 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  39.7 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  33.57 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  36.29 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  35.82 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 		 271 aa  132  7.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  53.39 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  28.92 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  34.93 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  34.08 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  37.36 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  30.56 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  34.18 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.69 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  35.66 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  33.83 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  31.02 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  33.1 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  31.54 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  49.58 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  34.64 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  37.81 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1922  phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  34.57 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 284 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  29.93 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  29.37 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  32.71 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  44.54 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  34.35 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  32.71 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  31.52 
 
 		 281 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  37.65 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  45.31 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  30.82 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  31.14 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  43.42 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.84 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  30.53 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  29.54 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  43.84 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  38.92 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  31.14 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  29.86 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.16 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  48.78 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  32.45 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  32.36 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  46.96 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  48.6 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  32.25 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  31.41 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  48.25 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  31.46 
 
 		 280 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  30.71 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  32.73 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  29.75 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  31.2 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  31.2 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  38.92 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  31.2 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  38.92 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  32.45 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  38.92 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  38.92 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  30.48 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  37.78 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  38.92 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  44.72 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  44.72 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  44.72 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  46.96 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  46.96 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  44.72 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  31.15 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  44.72 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  46.96 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  32 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  44.72 
 
 		 285 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>