More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1922 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1922  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 276 aa  538  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.85 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  34.17 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  32.51 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  31.52 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  37.13 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  31.52 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  30.65 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  32.08 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  30.99 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  28.51 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  34.71 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  30.86 
 
 		 712 aa  99.8  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  27.24 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  29.02 
 
 		 282 aa  99  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  32.18 
 
 		 281 aa  99  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  38.12 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  31.76 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  29.47 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  33.06 
 
 		 310 aa  95.9  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  41.92 
 
 		 290 aa  95.5  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  34.02 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  26.47 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  32.14 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  38.73 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  30.25 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 		 211 aa  94.4  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  28.68 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  42.95 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  29.34 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  29.88 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  36.57 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  41.86 
 
 		 216 aa  92.8  5e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  36.75 
 
 		 281 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  39.63 
 
 		 276 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  29.53 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  35.88 
 
 		 318 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  43.36 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  46.49 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  45.61 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  31.25 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  36.15 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  31.2 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  36.42 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  30.31 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  45.22 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  35.75 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  38.37 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  40.58 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  35.03 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  35.03 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  42.86 
 
 		 284 aa  89.7  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  36.53 
 
 		 307 aa  89.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  38.17 
 
 		 271 aa  89.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  34.55 
 
 		 287 aa  89  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  34.89 
 
 		 281 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 		 296 aa  89  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  33.59 
 
 		 252 aa  89  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.5 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  31.41 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2591  phosphatidate cytidylyltransferase  35.17 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.163491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  44.35 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  42.65 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  30.58 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  34.06 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  44.35 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  44.35 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  29.84 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  28.24 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  29.23 
 
 		 313 aa  86.3  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  41.13 
 
 		 281 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  38.76 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  39.37 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  28.24 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  32.77 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 		 246 aa  86.3  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2032  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  35.92 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 		 317 aa  85.5  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  42.62 
 
 		 276 aa  85.5  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  40.71 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  27.95 
 
 		 293 aa  85.5  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  43.36 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 241 aa  85.5  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  27.84 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.32 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>