More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1106 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
268 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  81.58 
 
 
271 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  82.33 
 
 
271 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  80.08 
 
 
271 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  79.32 
 
 
271 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  79.7 
 
 
271 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  80.08 
 
 
271 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  74.44 
 
 
271 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  74.44 
 
 
271 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  68.54 
 
 
271 aa  313  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  73.68 
 
 
271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  52.22 
 
 
281 aa  244  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  48.03 
 
 
285 aa  224  8e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  47.67 
 
 
282 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  47.67 
 
 
282 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  47.67 
 
 
282 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  48.39 
 
 
285 aa  221  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  49.81 
 
 
267 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.74 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  44.17 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  45.88 
 
 
285 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  47.5 
 
 
282 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  46.07 
 
 
285 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  46.07 
 
 
285 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  46.07 
 
 
285 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  46.07 
 
 
285 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  46.07 
 
 
285 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  45.71 
 
 
285 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.71 
 
 
285 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  45.71 
 
 
285 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  45.71 
 
 
285 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  45.71 
 
 
285 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  45.71 
 
 
285 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  45.71 
 
 
285 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  45.36 
 
 
285 aa  202  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  45.58 
 
 
285 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  43.98 
 
 
267 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  46.64 
 
 
274 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 
280 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  40.42 
 
 
287 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  41.4 
 
 
283 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  41.94 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  43.55 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  40.48 
 
 
285 aa  182  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  41.34 
 
 
287 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  41.34 
 
 
280 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  39.93 
 
 
285 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  46.5 
 
 
249 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 
285 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  40.78 
 
 
256 aa  175  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  41.29 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  39.5 
 
 
285 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  41.29 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  41.85 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
285 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  39.72 
 
 
285 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  38.79 
 
 
285 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2422  phosphatidate cytidylyltransferase  41.43 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522142  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  41.55 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  39.45 
 
 
285 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 
276 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  39.45 
 
 
285 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  40.86 
 
 
272 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
290 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
281 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  38.62 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  38.97 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  38.31 
 
 
328 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 
278 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  37.28 
 
 
284 aa  148  9e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0325  phosphatidate cytidylyltransferase  36.59 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  37.64 
 
 
265 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  40.21 
 
 
284 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
273 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  37.55 
 
 
261 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  36.5 
 
 
265 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  35.56 
 
 
270 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  38.21 
 
 
273 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  40.23 
 
 
272 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  40.07 
 
 
281 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  40.57 
 
 
275 aa  142  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.3 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1461  phosphatidate cytidylyltransferase  42.26 
 
 
274 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.152404  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  36.88 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  39.34 
 
 
273 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2047  phosphatidate cytidylyltransferase  38.65 
 
 
273 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
284 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
275 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  38.08 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  36.6 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  36.26 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  40.73 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6063  phosphatidate cytidylyltransferase  38.65 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  41.72 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  38.65 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1687  putative phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426329  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5324  phosphatidate cytidylyltransferase  37.94 
 
 
273 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0966585  normal  0.436888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>