More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0630 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 475 aa  911    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 280 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 263 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 		 272 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  30.74 
 
 		 341 aa  118  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.97 
 
 		 264 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 274 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 		 441 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  41.57 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  37.44 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  42.68 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  50.39 
 
 		 279 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  43.98 
 
 		 267 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 		 260 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  38.26 
 
 		 268 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  36.73 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  48.2 
 
 		 270 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  53.45 
 
 		 260 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 263 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 263 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 263 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 265 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 263 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  44.96 
 
 		 242 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  45.65 
 
 		 233 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 		 252 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  46.77 
 
 		 271 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 		 266 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3512  phosphatidate cytidylyltransferase  42.62 
 
 		 336 aa  110  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0503603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 		 263 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 		 263 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 		 339 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 		 271 aa  109  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  48.15 
 
 		 261 aa  109  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 		 246 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  39.47 
 
 		 263 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  42.58 
 
 		 254 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 		 256 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  48.78 
 
 		 265 aa  109  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  41.04 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  35.22 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  40.76 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  46.2 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  28.62 
 
 		 287 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  46.92 
 
 		 280 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 		 298 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 		 298 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  37.24 
 
 		 280 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 		 298 aa  107  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 263 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  35.37 
 
 		 298 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  37.28 
 
 		 205 aa  107  6e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  35.37 
 
 		 298 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.33 
 
 		 368 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  31.72 
 
 		 303 aa  106  8e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  32.41 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 260 aa  106  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  36.59 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  29.28 
 
 		 306 aa  106  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  44.88 
 
 		 281 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  34.76 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 255 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  36.62 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  42.34 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 260 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  39.47 
 
 		 261 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  32.66 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  41.1 
 
 		 268 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 260 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 		 211 aa  105  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  41.48 
 
 		 279 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  42.34 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  42.34 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  29.77 
 
 		 712 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  36.82 
 
 		 281 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  37.18 
 
 		 281 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  30.87 
 
 		 306 aa  104  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.55 
 
 		 281 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  44.97 
 
 		 284 aa  104  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  36.76 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 		 285 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  50 
 
 		 264 aa  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 		 241 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  46.34 
 
 		 285 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 273 aa  103  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  43.65 
 
 		 249 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  41.09 
 
 		 216 aa  103  8e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  37.26 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  41.67 
 
 		 264 aa  103  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 		 268 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 		 241 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 		 264 aa  102  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  48.25 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  33.59 
 
 		 281 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>