More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_14961 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
295 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
295 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09871  phosphatidate cytidylyltransferase  62.85 
 
 
304 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  63.27 
 
 
294 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  60.34 
 
 
301 aa  341  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  59.34 
 
 
285 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  57.04 
 
 
285 aa  322  3e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  61.99 
 
 
288 aa  319  3e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  57.39 
 
 
285 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  55.99 
 
 
285 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  44.52 
 
 
290 aa  232  7.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  43.43 
 
 
293 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  44.09 
 
 
295 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  44.09 
 
 
295 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 
288 aa  218  8.999999999999998e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  41.5 
 
 
332 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  43.84 
 
 
293 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  34.47 
 
 
364 aa  152  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  34.16 
 
 
280 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47250  predicted protein  31.68 
 
 
574 aa  134  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110596  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  30.53 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  29.47 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  30.45 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
242 aa  120  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  34.01 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  54.7 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  40.43 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  34.48 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  38.83 
 
 
280 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 
271 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  48.41 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  35.35 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  35.02 
 
 
271 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
280 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  35.02 
 
 
271 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  44.09 
 
 
241 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  44.59 
 
 
246 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  29.24 
 
 
275 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  49.59 
 
 
282 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  49.59 
 
 
282 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 
241 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  49.59 
 
 
282 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 
241 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  29.62 
 
 
271 aa  106  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  48.36 
 
 
285 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  48.36 
 
 
285 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 
285 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  48.36 
 
 
285 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  48.36 
 
 
285 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  48.36 
 
 
285 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  29.58 
 
 
263 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  47.9 
 
 
285 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  43.7 
 
 
284 aa  105  7e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  48.36 
 
 
282 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  49.59 
 
 
276 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  51.79 
 
 
275 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  46.72 
 
 
285 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  45.04 
 
 
285 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  46.72 
 
 
285 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  46.72 
 
 
285 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 
285 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  46.72 
 
 
285 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  46.72 
 
 
285 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  49.52 
 
 
270 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  40.54 
 
 
254 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  46.72 
 
 
285 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  46.72 
 
 
249 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  46.72 
 
 
285 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0209  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
247 aa  103  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.809934  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  52.94 
 
 
283 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  37.91 
 
 
280 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
254 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
286 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  47.93 
 
 
285 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  43.22 
 
 
280 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 
285 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  49.52 
 
 
278 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  31.51 
 
 
278 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
261 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  32.99 
 
 
267 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  32.65 
 
 
264 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  51.92 
 
 
243 aa  102  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000797314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  48.44 
 
 
271 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 
263 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  51.46 
 
 
285 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  51.46 
 
 
285 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  48.44 
 
 
271 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  31.99 
 
 
260 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  51.46 
 
 
290 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  35.64 
 
 
277 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
285 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 
285 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  50.48 
 
 
253 aa  101  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.61 
 
 
211 aa  100  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 
279 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  41.53 
 
 
256 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  49.06 
 
 
260 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>