More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2049 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  60.4 
 
 
258 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  52.61 
 
 
233 aa  221  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3728  phosphatidate cytidylyltransferase  52.72 
 
 
248 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1490  phosphatidate cytidylyltransferase  51.48 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2751  phosphatidate cytidylyltransferase  50.21 
 
 
255 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1255  phosphatidate cytidylyltransferase  54.26 
 
 
262 aa  185  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00219294  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  49.56 
 
 
236 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  39.61 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.97 
 
 
281 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  39.42 
 
 
281 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  36.63 
 
 
279 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  35.16 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  34.87 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  41.85 
 
 
277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  34.45 
 
 
267 aa  132  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  44.16 
 
 
260 aa  132  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  34.03 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  39.62 
 
 
274 aa  131  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
242 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  41.29 
 
 
260 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
272 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  33.87 
 
 
263 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  30.58 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  41.33 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  36.21 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  43.61 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  38.12 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  37.36 
 
 
278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  50.82 
 
 
246 aa  118  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  30.99 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  32.1 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  42.33 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  41.24 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  41.54 
 
 
282 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  30.99 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  38.61 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  38.61 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  31.69 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  30.99 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  38.61 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  38.61 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
261 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 
264 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  35.55 
 
 
307 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 
267 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  34.82 
 
 
264 aa  115  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 
280 aa  115  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  38.57 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  38.07 
 
 
280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  42.6 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  40.1 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  35.15 
 
 
275 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 
279 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  35.91 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  39.08 
 
 
295 aa  111  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  29.13 
 
 
282 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  33.73 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 
475 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  34.6 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  42.22 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  31.69 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  31.69 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  44.06 
 
 
284 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 
254 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  32.19 
 
 
266 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  40.69 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  45.6 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  33.6 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  41.26 
 
 
262 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 
285 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  40.43 
 
 
242 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  41.33 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000797314  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  42.45 
 
 
241 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  42.45 
 
 
241 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  33.73 
 
 
271 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  35.32 
 
 
286 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2591  phosphatidate cytidylyltransferase  34.17 
 
 
301 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.163491  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  48.12 
 
 
272 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  50.79 
 
 
269 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  41.35 
 
 
263 aa  107  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  48.12 
 
 
268 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  42.21 
 
 
261 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  49.21 
 
 
269 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  34.52 
 
 
268 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 
298 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 
298 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  30.3 
 
 
293 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  49.21 
 
 
275 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  40.67 
 
 
273 aa  106  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  41.01 
 
 
241 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  37.41 
 
 
271 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  33.47 
 
 
267 aa  106  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  43.22 
 
 
298 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  31.38 
 
 
712 aa  105  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 
205 aa  106  5e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  36.49 
 
 
258 aa  105  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 
298 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>