More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1008 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 289 aa  560  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  69.4 
 
 		 284 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  60.28 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  64.5 
 
 		 280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  58.24 
 
 		 403 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  50.57 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.29 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  46.74 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  46.64 
 
 		 441 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  45.02 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  43.02 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  46.99 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  43.12 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  44.15 
 
 		 339 aa  195  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  41.04 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  39.22 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  39.78 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  46.04 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  38.57 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  43.96 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  46.79 
 
 		 290 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  42.16 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  42.16 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  42.16 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  44.91 
 
 		 277 aa  181  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  41.44 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  39.77 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  44.16 
 
 		 352 aa  165  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  38.75 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  34.41 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  37.79 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  32.25 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  29.97 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  50.83 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  35.93 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  40.96 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  43.54 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  32.86 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  31.8 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  31.17 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  31.4 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  30.74 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  30.71 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  35.4 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  39.16 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  34.08 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  45.97 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  43.1 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  44.35 
 
 		 712 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  31.78 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  27.3 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  38.06 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  37.76 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  35.62 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  44.06 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  34.57 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  37.28 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 		 475 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  32.4 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  39.36 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  34.88 
 
 		 351 aa  99.8  5e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2591  phosphatidate cytidylyltransferase  36.02 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.163491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  41.45 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  35.51 
 
 		 342 aa  99.4  7e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  32.74 
 
 		 274 aa  99.4  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  43.61 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 		 269 aa  99  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  31.3 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  46.61 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  32.77 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  30.93 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  44.37 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  30.93 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  42.61 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>