More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3987 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 348 aa  656    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  56.99 
 
 		 293 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  56.36 
 
 		 281 aa  282  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  52.77 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  57.56 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  51.46 
 
 		 339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  53.9 
 
 		 441 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  51.61 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  52.83 
 
 		 368 aa  245  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  53.93 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  48.07 
 
 		 292 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  53.31 
 
 		 484 aa  238  8e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  51.11 
 
 		 313 aa  233  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  47.67 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  47.67 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  47.67 
 
 		 284 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  51.7 
 
 		 290 aa  228  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  49.82 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  47.08 
 
 		 284 aa  222  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  48.68 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  46.18 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  46.99 
 
 		 289 aa  219  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  43.71 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.67 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  47.96 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  43.27 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  45.82 
 
 		 301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  45.85 
 
 		 296 aa  212  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  43.23 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  41.33 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  47.43 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  41.49 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  42.96 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  39.25 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  32.14 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  43.38 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  28.66 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.36 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  43.02 
 
 		 267 aa  109  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  43.02 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  42.46 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  27.79 
 
 		 475 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  32.93 
 
 		 280 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  40.11 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  29.65 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.42 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  42.35 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  32.18 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  40.12 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  32.27 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  37.37 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  31.8 
 
 		 269 aa  99.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  35.53 
 
 		 303 aa  99.4  8e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  31.54 
 
 		 284 aa  99  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  37.04 
 
 		 275 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  36.76 
 
 		 280 aa  98.2  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  34.97 
 
 		 278 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  39.11 
 
 		 269 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 271 aa  97.1  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  31.3 
 
 		 264 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  46.62 
 
 		 281 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.85 
 
 		 279 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  39.39 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.77 
 
 		 307 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  30.87 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  45.54 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  42.52 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  42.52 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  36.09 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  41.01 
 
 		 274 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  42.52 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  40.48 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.61 
 
 		 281 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  45.93 
 
 		 262 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  36.65 
 
 		 242 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.81 
 
 		 277 aa  94  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  30.28 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 		 342 aa  93.6  5e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 		 260 aa  93.2  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  38.52 
 
 		 265 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 273 aa  92.8  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 		 272 aa  92.8  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 		 285 aa  92.4  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  37.5 
 
 		 282 aa  92.8  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 		 268 aa  92.8  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  37.5 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  30.96 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  42.48 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 		 285 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>