More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1538 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 291 aa  545  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  41.08 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  40.73 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  46.62 
 
 		 313 aa  178  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  42.29 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  45.22 
 
 		 348 aa  171  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  42.59 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.66 
 
 		 368 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  43.94 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  42.8 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  38.95 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  36.91 
 
 		 322 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  41.55 
 
 		 441 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 		 311 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  44.48 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  37.37 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  39.3 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  39.5 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  43.49 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  40.37 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  41.2 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  37.89 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  36.55 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  37.33 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 		 484 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  32.41 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  39.22 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  39.22 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  39.22 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.81 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  51.72 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  37.33 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  32.05 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  40.41 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  30.16 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  46.34 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.49 
 
 		 475 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  43.26 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  50.89 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  40.65 
 
 		 712 aa  103  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  43.24 
 
 		 272 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  36.81 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  30.36 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  36.81 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  42.54 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  41.79 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  44.8 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  40.67 
 
 		 341 aa  97.4  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1500  phosphatidate cytidylyltransferase  27.84 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  37.42 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  36.91 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  44.88 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  40.68 
 
 		 265 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  38.82 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  38.15 
 
 		 280 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 242 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 268 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  32.62 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  48.65 
 
 		 269 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 		 317 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  30.8 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  44.44 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  40.34 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  37.27 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  48.48 
 
 		 254 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  40.34 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 260 aa  92.4  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  35.4 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  35.4 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  35.4 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  33.79 
 
 		 282 aa  92  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  38.79 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  44.09 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  45.71 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.83 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>