More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1165 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
352 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  68.99 
 
 
313 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  52.38 
 
 
348 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  46.86 
 
 
293 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  48.38 
 
 
290 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  46.52 
 
 
276 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  47.12 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  49.1 
 
 
281 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  46.05 
 
 
292 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  42.77 
 
 
308 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  48.13 
 
 
368 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
441 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  45.62 
 
 
281 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  43.81 
 
 
339 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  46.48 
 
 
287 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  43.73 
 
 
292 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  43.22 
 
 
284 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  46.74 
 
 
277 aa  193  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  44.89 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  40.88 
 
 
306 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  45.85 
 
 
484 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  41.95 
 
 
297 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  42.53 
 
 
296 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  38.06 
 
 
306 aa  176  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.98 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  47.08 
 
 
280 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
322 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
284 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
284 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  44.16 
 
 
284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  45.91 
 
 
291 aa  162  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  39.54 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  38.53 
 
 
301 aa  159  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  44.52 
 
 
302 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  40.36 
 
 
278 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  58.26 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  28.75 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.9 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  31.58 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  35.98 
 
 
303 aa  106  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 
271 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 
268 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 
271 aa  104  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 
341 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  36.29 
 
 
274 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  46.32 
 
 
271 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  39.87 
 
 
260 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  40.52 
 
 
267 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  45.93 
 
 
271 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  37.99 
 
 
286 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  45.93 
 
 
271 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
265 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 
269 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  43.61 
 
 
364 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
279 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 
280 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  48.65 
 
 
277 aa  99.8  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  38.67 
 
 
271 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  45.83 
 
 
265 aa  99.4  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  32.81 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  38.56 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  40.85 
 
 
285 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
208 aa  98.6  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
276 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  36.31 
 
 
260 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  36.31 
 
 
260 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
273 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.07 
 
 
475 aa  96.7  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  42.33 
 
 
262 aa  97.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 
271 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 
271 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  39.87 
 
 
262 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  32.66 
 
 
264 aa  95.9  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  45.76 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  32.39 
 
 
275 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 
287 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  39.76 
 
 
271 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 
281 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
276 aa  94.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  39.76 
 
 
271 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  43.08 
 
 
282 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  47.27 
 
 
268 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  36.42 
 
 
295 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  36.42 
 
 
295 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  26.92 
 
 
258 aa  93.2  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 
272 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  29.07 
 
 
264 aa  93.6  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  40.3 
 
 
712 aa  92.8  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  34.57 
 
 
261 aa  92.8  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 
313 aa  92.8  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 
295 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 
295 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
269 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  33.33 
 
 
280 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  44.27 
 
 
274 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  43.94 
 
 
260 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>