More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2202 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 339 aa  658    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  57.3 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  58.97 
 
 		 484 aa  262  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  48.97 
 
 		 293 aa  255  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  54.74 
 
 		 277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  51.46 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  49.25 
 
 		 276 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  49.63 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  50.57 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 		 292 aa  226  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  46.64 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  44.56 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  48.51 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  47.96 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  45.21 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  45.39 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  45.21 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  45.21 
 
 		 284 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  44.96 
 
 		 308 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  42.62 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  44.15 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  41.14 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  45.72 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  43.24 
 
 		 296 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.42 
 
 		 403 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  46.07 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  45.14 
 
 		 291 aa  196  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  40.07 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  39.51 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 		 280 aa  182  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  46.52 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  42.96 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  41.24 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  35.45 
 
 		 343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  29.28 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.12 
 
 		 475 aa  113  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  34.91 
 
 		 272 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  47.73 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  30.32 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  35.97 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  35.68 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  42.03 
 
 		 271 aa  106  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  46.97 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  34.97 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  38.04 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  38.3 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  34.18 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  39.37 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 		 272 aa  99.8  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 		 271 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 		 268 aa  99.8  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 		 268 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 268 aa  99.4  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  40.67 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 		 282 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 		 271 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  32.65 
 
 		 267 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 264 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  45.16 
 
 		 269 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  29.2 
 
 		 278 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  34.36 
 
 		 260 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  40.54 
 
 		 271 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  33.1 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  28.27 
 
 		 282 aa  96.3  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  28.27 
 
 		 282 aa  96.3  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  34.3 
 
 		 252 aa  96.3  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  28.27 
 
 		 282 aa  96.3  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  40.67 
 
 		 262 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.57 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  35.62 
 
 		 264 aa  95.9  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  40.69 
 
 		 233 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  36.88 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  40 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 		 265 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 		 267 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 		 310 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  38.22 
 
 		 285 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  40.54 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  41.73 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  37.14 
 
 		 260 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  37.25 
 
 		 285 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  31.68 
 
 		 341 aa  94.4  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  37.14 
 
 		 260 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.41 
 
 		 265 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  35.67 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  36.77 
 
 		 280 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 		 254 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  31.51 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  37.33 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  28.03 
 
 		 275 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>