More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2051 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  99.65 
 
 
284 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  89.29 
 
 
292 aa  500  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  73.05 
 
 
292 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  60.7 
 
 
306 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  61.43 
 
 
297 aa  326  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  59.01 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  54.24 
 
 
293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  52.98 
 
 
281 aa  269  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  47.67 
 
 
348 aa  231  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  51.09 
 
 
277 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  45.72 
 
 
276 aa  218  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  45.05 
 
 
339 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  48.74 
 
 
301 aa  208  7e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 
287 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  44.17 
 
 
281 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  39.36 
 
 
284 aa  196  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.32 
 
 
368 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  47.08 
 
 
441 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 
311 aa  195  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 
313 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  42.16 
 
 
289 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
484 aa  185  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  41.4 
 
 
308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  39.93 
 
 
308 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  38.87 
 
 
322 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  38.7 
 
 
306 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  41.73 
 
 
291 aa  168  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  44.14 
 
 
302 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  39.48 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
352 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.83 
 
 
403 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  40.36 
 
 
280 aa  151  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  37.41 
 
 
278 aa  142  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  34.41 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  29.64 
 
 
343 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  35.83 
 
 
280 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  51.85 
 
 
277 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  50.43 
 
 
291 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  40.46 
 
 
285 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.32 
 
 
475 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  35.57 
 
 
280 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  39.88 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 
269 aa  99  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  36.81 
 
 
264 aa  99  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  33.53 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  36.2 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.94 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  33.95 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.52 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  31.2 
 
 
296 aa  96.3  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  31.31 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  35.76 
 
 
260 aa  96.3  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  30.58 
 
 
287 aa  96.3  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  40.29 
 
 
242 aa  95.9  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  40.36 
 
 
282 aa  95.5  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  40.24 
 
 
282 aa  95.5  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  40.36 
 
 
282 aa  95.5  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  40.36 
 
 
282 aa  95.5  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  40.65 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  44.86 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  35.16 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  43.22 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  42.37 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  31.74 
 
 
265 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  34.52 
 
 
281 aa  94  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  28.51 
 
 
278 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 
318 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  40.38 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.38 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0209  phosphatidate cytidylyltransferase  37.33 
 
 
247 aa  92.8  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.809934  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  32.16 
 
 
341 aa  92.4  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  43.59 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  37.96 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
270 aa  92.4  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 
268 aa  92  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  32.14 
 
 
342 aa  92  9e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 
277 aa  92  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  40.74 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  40.74 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  40.74 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>