More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1326 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 484 aa  941    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  77.23 
 
 		 441 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  60.07 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  53.31 
 
 		 348 aa  250  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  51.08 
 
 		 293 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  51.87 
 
 		 276 aa  243  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  50.74 
 
 		 281 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  50.18 
 
 		 313 aa  220  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  52.03 
 
 		 277 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  50.57 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  48.48 
 
 		 284 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  45.99 
 
 		 292 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  45.62 
 
 		 292 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  48.77 
 
 		 290 aa  209  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  49.44 
 
 		 308 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  49.06 
 
 		 281 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 		 311 aa  206  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 289 aa  204  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  46 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  45.63 
 
 		 308 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  49.24 
 
 		 287 aa  199  7.999999999999999e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  42.81 
 
 		 306 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 284 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 284 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  48.03 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 284 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  46.86 
 
 		 352 aa  193  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  50.91 
 
 		 280 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  41.32 
 
 		 306 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  42.09 
 
 		 297 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  44.52 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  43.65 
 
 		 301 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  45.61 
 
 		 302 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  45.45 
 
 		 278 aa  161  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.3 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  31.61 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  30.64 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  32.89 
 
 		 343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.97 
 
 		 279 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.86 
 
 		 280 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 274 aa  113  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  42.26 
 
 		 282 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  43.49 
 
 		 291 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 		 272 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  43.87 
 
 		 254 aa  107  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  46.61 
 
 		 282 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  47.45 
 
 		 280 aa  106  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  42.86 
 
 		 249 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 280 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 		 275 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  51.22 
 
 		 268 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  38.06 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 		 271 aa  102  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  41.45 
 
 		 285 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  39.51 
 
 		 280 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  47.55 
 
 		 268 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  40.62 
 
 		 285 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.77 
 
 		 285 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 		 260 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 286 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  41.55 
 
 		 303 aa  98.6  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 		 259 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 		 256 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  35.46 
 
 		 275 aa  98.2  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  43.94 
 
 		 293 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  41.1 
 
 		 282 aa  97.8  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  41.1 
 
 		 282 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  41.1 
 
 		 282 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  32.87 
 
 		 280 aa  97.8  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  32.13 
 
 		 285 aa  97.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 233 aa  97.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  40.51 
 
 		 282 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  43.61 
 
 		 266 aa  96.3  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 		 287 aa  96.3  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  44.09 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  46.31 
 
 		 268 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  45.3 
 
 		 310 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  48.8 
 
 		 281 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  43.55 
 
 		 294 aa  94.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  38.27 
 
 		 261 aa  94.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  36.82 
 
 		 296 aa  94  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 		 285 aa  94  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  30.04 
 
 		 258 aa  94  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 		 285 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>