More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3239 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 308 aa  595  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  52.16 
 
 		 276 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  48.78 
 
 		 281 aa  235  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.08 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  46.31 
 
 		 348 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  47.92 
 
 		 293 aa  230  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  50.72 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  43.96 
 
 		 339 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  47.86 
 
 		 277 aa  218  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  44.12 
 
 		 308 aa  215  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  47.48 
 
 		 441 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  44.49 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  47.29 
 
 		 290 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 		 292 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  42.23 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  40.83 
 
 		 322 aa  195  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  43.23 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  42.05 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 484 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  41.4 
 
 		 284 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  41.4 
 
 		 284 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  44.84 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.52 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  41.4 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  38.36 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  42.65 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  39.55 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  43.23 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  45.62 
 
 		 280 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  39.24 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  40.29 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  31.66 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  40.78 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  29.11 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  35.12 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.64 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  34.65 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  35.12 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.12 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  50.48 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  32.77 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 		 279 aa  99.4  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  30.25 
 
 		 258 aa  99  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  28.9 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  31.97 
 
 		 267 aa  99  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  32.38 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  31.97 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  35.59 
 
 		 281 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  29.32 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  45.87 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  33.67 
 
 		 281 aa  96.7  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  40.31 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  34.68 
 
 		 281 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 		 280 aa  95.9  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 		 280 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  30.95 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  35.91 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  38.71 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.48 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  35.91 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  46.36 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  42.06 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 		 271 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  44.95 
 
 		 268 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  34.68 
 
 		 285 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  44.09 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  45.83 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  44.74 
 
 		 712 aa  92.8  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 		 269 aa  92.8  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  35.89 
 
 		 280 aa  92.4  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  36.62 
 
 		 342 aa  92.4  9e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  35.5 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  34.88 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.5 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  35.5 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  35.5 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  36.99 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  38.21 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  35.5 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  34.88 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  35.5 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  34.88 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  34.88 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  34.1 
 
 		 249 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  34.88 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  40.12 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  35.5 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>