More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0340 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
342 aa  659    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  37 
 
 
351 aa  181  2e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  46.83 
 
 
265 aa  112  7.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 
267 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  40.69 
 
 
267 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 
302 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 
260 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  39.64 
 
 
261 aa  106  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 
260 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  40.69 
 
 
267 aa  106  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
267 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  40.14 
 
 
280 aa  106  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  44.83 
 
 
264 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  36.65 
 
 
341 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  39.88 
 
 
263 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  38.82 
 
 
280 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 
260 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  39.25 
 
 
272 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  37.32 
 
 
284 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0593  phosphatidate cytidylyltransferase  39.61 
 
 
381 aa  101  2e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 
282 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  38.82 
 
 
260 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  35.51 
 
 
289 aa  99.4  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.84 
 
 
285 aa  99.8  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 
339 aa  99.4  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
273 aa  99.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  38.13 
 
 
275 aa  99  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  35.25 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 
264 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4943  phosphatidate cytidylyltransferase  43.08 
 
 
284 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 
285 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  34.44 
 
 
261 aa  97.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  36.3 
 
 
271 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  29.2 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  36.17 
 
 
272 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  42.4 
 
 
282 aa  96.3  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  35.44 
 
 
263 aa  96.3  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  36.3 
 
 
280 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 
272 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  37.28 
 
 
273 aa  95.9  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  41.6 
 
 
282 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  41.6 
 
 
282 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  41.6 
 
 
282 aa  95.9  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.43 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  34.38 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
306 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  40.43 
 
 
249 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  38.85 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  37.59 
 
 
441 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  43.07 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
281 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  42.65 
 
 
282 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  30.4 
 
 
269 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  43.2 
 
 
284 aa  94.4  3e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.77 
 
 
264 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  37.75 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 
268 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 
276 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0708389 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 
297 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  37.59 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  37.23 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  37.75 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 
348 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 
285 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  41.35 
 
 
271 aa  92.8  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  38.19 
 
 
310 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  33.79 
 
 
278 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  32.14 
 
 
284 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  32.14 
 
 
284 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  38.36 
 
 
264 aa  92.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  36.62 
 
 
308 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  32.14 
 
 
284 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  38.26 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
208 aa  91.3  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  36.5 
 
 
258 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  35.84 
 
 
262 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2032  phosphatidate cytidylyltransferase  37.23 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  38.51 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  40.77 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  38.24 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  33.1 
 
 
292 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 
264 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  38.26 
 
 
284 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>