More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2084 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
286 aa  531  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  98.25 
 
 
286 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  88.81 
 
 
286 aa  484  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  59.93 
 
 
285 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  55.21 
 
 
294 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  53.05 
 
 
281 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  42.44 
 
 
280 aa  148  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  40.51 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  45.06 
 
 
270 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  41.79 
 
 
282 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  40.07 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  36.5 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 
282 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  42.51 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  40.23 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  37.19 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
276 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  38.73 
 
 
282 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  38.04 
 
 
272 aa  122  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 
270 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  53.38 
 
 
229 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  51.06 
 
 
280 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  45.27 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  28.85 
 
 
216 aa  110  3e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 
261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  35.61 
 
 
280 aa  109  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  44.96 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  39.46 
 
 
268 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  36.47 
 
 
262 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  43.61 
 
 
264 aa  106  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  49.56 
 
 
264 aa  105  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  44.07 
 
 
265 aa  105  9e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  42.26 
 
 
270 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 
260 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
263 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  45.31 
 
 
221 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  37.45 
 
 
267 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  43.75 
 
 
263 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
264 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  45.88 
 
 
285 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
211 aa  101  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
242 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  44.79 
 
 
287 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
273 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
273 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
259 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  54.46 
 
 
263 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  52.73 
 
 
294 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  43.88 
 
 
264 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  46.02 
 
 
264 aa  99.8  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 
205 aa  99.4  6e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  30.74 
 
 
269 aa  99.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.95 
 
 
280 aa  99  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 
260 aa  99  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 
208 aa  97.8  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  35.64 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  45.97 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 
267 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  45.3 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  45.3 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  45.3 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  41.98 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  41.98 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  47.86 
 
 
285 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  36.92 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  43.15 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  43.12 
 
 
265 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  43.15 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 
252 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  42.57 
 
 
277 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  45.3 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  29.66 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
268 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  43.1 
 
 
261 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  37.82 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  39.08 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 
285 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  36.15 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.71 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  43.71 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  43.71 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>