More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2150 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
273 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  87.55 
 
 
273 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  86.81 
 
 
273 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3996  phosphatidate cytidylyltransferase  44.49 
 
 
284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428683  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  50.59 
 
 
263 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
265 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 
283 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  35.25 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 
300 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  38.13 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  40.24 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  35.43 
 
 
277 aa  118  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  34.67 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  52.99 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  36.58 
 
 
282 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
282 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  35.68 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  39.53 
 
 
270 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  35.68 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  33.99 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  42.13 
 
 
268 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  49.57 
 
 
280 aa  112  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  35.91 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  37.34 
 
 
270 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  32.5 
 
 
205 aa  107  1e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  38.28 
 
 
280 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 
282 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  36.06 
 
 
271 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  31.62 
 
 
263 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  48.37 
 
 
285 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  36.48 
 
 
211 aa  106  5e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  31.27 
 
 
296 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  45.31 
 
 
221 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  43.67 
 
 
285 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  36.59 
 
 
281 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 
271 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 
271 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  33.82 
 
 
208 aa  104  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 
277 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.96 
 
 
264 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  41.8 
 
 
265 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 
289 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  34.83 
 
 
271 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  43.59 
 
 
264 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  35.85 
 
 
216 aa  101  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  45.71 
 
 
285 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  45.24 
 
 
285 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 
285 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 
285 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  45.24 
 
 
285 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  45.24 
 
 
285 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 
285 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  41.77 
 
 
285 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  45.24 
 
 
285 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 
285 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 
285 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 
285 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  45.24 
 
 
285 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  45.24 
 
 
285 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  31.89 
 
 
271 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  32.43 
 
 
271 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  45.24 
 
 
249 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 
294 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  42.61 
 
 
261 aa  99.8  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 
285 aa  99  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  28.62 
 
 
272 aa  99  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
241 aa  99  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  32.05 
 
 
271 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  31.03 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  33.72 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1374  phosphatidate cytidylyltransferase  33.09 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.19741  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  31.45 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  30.66 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  38.96 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  30.64 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  34.86 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  34.86 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  46.1 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  33.05 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  38 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  31.85 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  34.64 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  31.85 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.43 
 
 
280 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  32.54 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  33.72 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  31.85 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  32.56 
 
 
271 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  29.74 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  32.75 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  47.71 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  32.57 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 
241 aa  95.5  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>