More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2456 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
283 aa  544  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  36.19 
 
 
273 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  35.14 
 
 
273 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  37.64 
 
 
273 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 
263 aa  148  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3996  phosphatidate cytidylyltransferase  39.31 
 
 
284 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428683  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  35.69 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  35.9 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  34.11 
 
 
300 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  34.35 
 
 
294 aa  106  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  44.64 
 
 
282 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 
282 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  36.05 
 
 
270 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  33.68 
 
 
288 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  31.91 
 
 
271 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
268 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1374  phosphatidate cytidylyltransferase  31.77 
 
 
248 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.19741  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  38.22 
 
 
216 aa  100  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  44.12 
 
 
268 aa  99.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.99 
 
 
264 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  32.49 
 
 
271 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  34.21 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  34.08 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  29.56 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
211 aa  97.4  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  44.8 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  39.35 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  33.89 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  45.74 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.18 
 
 
285 aa  95.9  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  28.29 
 
 
272 aa  95.5  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 
276 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  44.04 
 
 
265 aa  95.5  9e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  32.85 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  43.36 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  43.38 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  35.67 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  37.09 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.09 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  37.09 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  37.09 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  37.09 
 
 
249 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  37.09 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  37.09 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  37.09 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  37.09 
 
 
285 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  37.09 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  37.09 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  37.09 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  39.5 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  37.09 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  28.81 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 
282 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  42.4 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  42.19 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  33.08 
 
 
280 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  37.74 
 
 
205 aa  93.2  4e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 
263 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  36.42 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  29.2 
 
 
271 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  27.74 
 
 
268 aa  92  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  39.47 
 
 
264 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  34.41 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 
269 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  34.41 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  34.41 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  42.48 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  32.61 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  39.53 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 
284 aa  90.1  3e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  41.53 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  29.39 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  36.67 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  28.83 
 
 
271 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
221 aa  89.7  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  46.73 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  38.52 
 
 
241 aa  89.4  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 
241 aa  89  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  30.59 
 
 
285 aa  89  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  39.23 
 
 
263 aa  89  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
241 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  37.96 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2032  phosphatidate cytidylyltransferase  49.14 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  39.53 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  35.04 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  46.79 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>