More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0465 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
268 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  39.47 
 
 
280 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 
276 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  40.61 
 
 
277 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  40.86 
 
 
276 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  42.07 
 
 
285 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  38.17 
 
 
272 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  40.49 
 
 
221 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  54.3 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  39.31 
 
 
289 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  55.15 
 
 
229 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  37.07 
 
 
278 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  37.65 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  41.11 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  39 
 
 
282 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  52.05 
 
 
285 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.1 
 
 
211 aa  125  6e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  38.75 
 
 
286 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  38.01 
 
 
280 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  40.4 
 
 
216 aa  122  7e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
205 aa  122  7e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  54.26 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  37.4 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  45.59 
 
 
264 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  34.6 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  36.9 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1374  phosphatidate cytidylyltransferase  34.15 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.19741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  49.65 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  37.26 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  33.47 
 
 
242 aa  115  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  50.37 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  51.35 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  38.87 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 
241 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  43.92 
 
 
241 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  36.8 
 
 
294 aa  112  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  31.85 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  32.43 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  32.43 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  31.48 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  50.41 
 
 
273 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  31.87 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  43.24 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  43.23 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  31.87 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  45 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  31.87 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  48.57 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  43.42 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  41.89 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  45.62 
 
 
275 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  49.18 
 
 
287 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
242 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  39.07 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  55.88 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  47.97 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
260 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 
264 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.59 
 
 
261 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  33.91 
 
 
285 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  50.42 
 
 
280 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  30.68 
 
 
277 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  45.65 
 
 
265 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  34.97 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  46.01 
 
 
273 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  28.37 
 
 
269 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  35.63 
 
 
268 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  47.5 
 
 
280 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
254 aa  106  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  36.05 
 
 
271 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  28.52 
 
 
296 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 
276 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 
285 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  45.07 
 
 
274 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 
271 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  44.38 
 
 
275 aa  105  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  48.3 
 
 
271 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  45.38 
 
 
282 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  46.94 
 
 
271 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
272 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  32.99 
 
 
285 aa  105  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
264 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  44.85 
 
 
265 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  31.73 
 
 
282 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  32.99 
 
 
285 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  42.64 
 
 
285 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  42.64 
 
 
285 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  31.82 
 
 
276 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  48.59 
 
 
273 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
252 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  42.64 
 
 
285 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>