More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0634 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 281 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  83.79 
 
 		 294 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  56.36 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  54.68 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  56.04 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  55.31 
 
 		 286 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  48.81 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  40.58 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  43.4 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  43.12 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  44.4 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  44.4 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  43.6 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 282 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  43.24 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  40.73 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  38.99 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  39.16 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  49.11 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  39.18 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  51.83 
 
 		 285 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 		 221 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.88 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  43.22 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  42.31 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  53.49 
 
 		 229 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  46.94 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  46.94 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  41.85 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.62 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  42.62 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  49.58 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  36.17 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  45.97 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  45.54 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  45 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  45 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  41.14 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  44.9 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  45.95 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  47.76 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  37.85 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  49.57 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  46.96 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  46.62 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  27.21 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  38.98 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 		 270 aa  99.4  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  34.19 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  26.44 
 
 		 269 aa  98.6  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  40.38 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3996  phosphatidate cytidylyltransferase  50.43 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428683  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  45.77 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  44.09 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 342 aa  97.1  3e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  45.74 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 		 233 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.14 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  31.07 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  48.85 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  45.76 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  43.62 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  47.86 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  33.78 
 
 		 341 aa  95.5  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  39.64 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  37.43 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  37.43 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  48.85 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  37.43 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>