More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2034 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
270 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  87.41 
 
 
270 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  87.41 
 
 
278 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  47.78 
 
 
272 aa  227  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  48.06 
 
 
280 aa  205  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 
277 aa  201  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
276 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
276 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  46.91 
 
 
270 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  50.75 
 
 
285 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  41.96 
 
 
282 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  40.08 
 
 
282 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  43.66 
 
 
280 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 
286 aa  152  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 
280 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  42.26 
 
 
285 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  43.08 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  38.83 
 
 
300 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  38.8 
 
 
268 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 
282 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  52.63 
 
 
268 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
281 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  53.57 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  35.47 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  36.4 
 
 
273 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
281 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  35.09 
 
 
273 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
259 aa  122  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  39.44 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 
261 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  33.46 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  35.8 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  51.26 
 
 
221 aa  118  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  33.33 
 
 
265 aa  118  9e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  37.02 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  48.55 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  51.24 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  34.36 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  39.19 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  44.03 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  52.21 
 
 
263 aa  112  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  42.59 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  32.18 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  31.8 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  31.8 
 
 
267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  45.6 
 
 
260 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.26 
 
 
264 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  44.16 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  52.42 
 
 
276 aa  108  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 
283 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  31.79 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  49.03 
 
 
287 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  43.4 
 
 
296 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
280 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  38.35 
 
 
211 aa  107  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  35.11 
 
 
287 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  34.83 
 
 
274 aa  106  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 
281 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  52.07 
 
 
273 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  31.47 
 
 
263 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 
268 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 
274 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 
208 aa  105  5e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  49.25 
 
 
271 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
271 aa  105  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  40.77 
 
 
296 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  38.6 
 
 
266 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 
272 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  31.77 
 
 
284 aa  103  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  29.73 
 
 
263 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  42.04 
 
 
263 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  44.08 
 
 
233 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  29.41 
 
 
260 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  48.78 
 
 
285 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 
275 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  29.41 
 
 
260 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 
265 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  42.2 
 
 
341 aa  103  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  35.11 
 
 
254 aa  103  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  51.26 
 
 
273 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  51.61 
 
 
278 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  46.92 
 
 
276 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.79 
 
 
475 aa  102  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
205 aa  102  5e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  46.96 
 
 
282 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
242 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  48.87 
 
 
271 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0790  phosphatidate cytidylyltransferase  54.84 
 
 
268 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.203528 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 
280 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  35.93 
 
 
281 aa  102  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  40.99 
 
 
287 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>