More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0298 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 296 aa  566  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  47.75 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  37.46 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  35.74 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  38.72 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  38.82 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  38.29 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  43.01 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  37.28 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  37.19 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  41.09 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 		 294 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  37.59 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  38.52 
 
 		 276 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  39.36 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  38.97 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  37.02 
 
 		 282 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  40.43 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  40.07 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  41.57 
 
 		 281 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  36.12 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  34.67 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  45.12 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  45.81 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  35.8 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  35 
 
 		 211 aa  109  5e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  31.38 
 
 		 273 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  31.38 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  33.71 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  35.9 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  38.82 
 
 		 216 aa  107  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  31.23 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  37.74 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  31.82 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  36.07 
 
 		 221 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  31.34 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 263 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  32.83 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  40.44 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  37.67 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  52.63 
 
 		 276 aa  96.3  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  42.02 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1374  phosphatidate cytidylyltransferase  31.49 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.19741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.1 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.15 
 
 		 264 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3996  phosphatidate cytidylyltransferase  43.26 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428683  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  48.65 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  39.33 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  30.81 
 
 		 306 aa  92.4  7e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  30.45 
 
 		 271 aa  92.4  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  41.67 
 
 		 282 aa  92.4  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  41.67 
 
 		 282 aa  92.4  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  41.67 
 
 		 282 aa  92.4  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  38.26 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  40.97 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  44.54 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  44.54 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  44.54 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  33.04 
 
 		 272 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  44.54 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  29.23 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 264 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 		 264 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  44.54 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  44.54 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  44.54 
 
 		 263 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  44.54 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  36.86 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  41.26 
 
 		 264 aa  90.9  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  42.38 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  48.28 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  41.09 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  40.83 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  34.93 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  42.4 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 		 272 aa  89.4  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>