More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1699 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
280 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  80 
 
 
280 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  60.28 
 
 
282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  61.35 
 
 
282 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  64.89 
 
 
282 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  59.22 
 
 
282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  59.62 
 
 
289 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  41.43 
 
 
280 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  40.84 
 
 
296 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  40.22 
 
 
276 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  40.75 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 
300 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  41.12 
 
 
277 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 
268 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  39.7 
 
 
270 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  39.7 
 
 
278 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
270 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  42.16 
 
 
270 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  39.55 
 
 
285 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  39.25 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  50.67 
 
 
294 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  38.17 
 
 
294 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 
286 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  37.98 
 
 
268 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  45.12 
 
 
286 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  52.34 
 
 
264 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  45.33 
 
 
273 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  45.33 
 
 
273 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  45.12 
 
 
286 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  35.91 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  52.6 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  44.78 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  33.47 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  46 
 
 
281 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
264 aa  115  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  53.54 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  36.2 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.77 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 
285 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  36.57 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  47.9 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  47.9 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  32.33 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  39.22 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  43.48 
 
 
264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  31.32 
 
 
280 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 
268 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  37.45 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  47.9 
 
 
260 aa  109  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 
271 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  48.39 
 
 
285 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
211 aa  108  7.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  41.42 
 
 
287 aa  108  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  34.88 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 
271 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 
283 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  50.38 
 
 
265 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  44.97 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  41.43 
 
 
256 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  41.43 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  41.43 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  45.53 
 
 
265 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  37.17 
 
 
271 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  33.6 
 
 
261 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 
285 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  49.12 
 
 
268 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
285 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  37.01 
 
 
280 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  40.91 
 
 
263 aa  106  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.4 
 
 
261 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
254 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  46.92 
 
 
270 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  49.18 
 
 
271 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  32.71 
 
 
263 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  41.22 
 
 
282 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  34.95 
 
 
280 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  39.71 
 
 
271 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  32.71 
 
 
263 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  32.71 
 
 
263 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  45.3 
 
 
216 aa  104  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  32.6 
 
 
282 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  32.71 
 
 
263 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
221 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  48.82 
 
 
274 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  48.36 
 
 
271 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  48.99 
 
 
287 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  31.87 
 
 
282 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  31.87 
 
 
282 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
285 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  31.87 
 
 
282 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
267 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 
285 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  32.76 
 
 
275 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  51.67 
 
 
278 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 
285 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  50.86 
 
 
242 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>