More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1588 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
276 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  93.12 
 
 
276 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  60.99 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  55.6 
 
 
280 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  44.13 
 
 
270 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  44.13 
 
 
278 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  45.71 
 
 
270 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
285 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  39.16 
 
 
272 aa  161  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  46.5 
 
 
270 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  42.39 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  38.01 
 
 
296 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  41.42 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  40.44 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  38.43 
 
 
282 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 
268 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  41.63 
 
 
289 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  39.42 
 
 
300 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  40.34 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  39.27 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  38.75 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  40.08 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 
268 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  43.15 
 
 
281 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  36.9 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  36.8 
 
 
286 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  52.29 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  37.04 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
259 aa  125  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  35.14 
 
 
287 aa  122  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  36.93 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  37.11 
 
 
294 aa  118  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  53.49 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  35.63 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.94 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  51.11 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  43.46 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  52.34 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  34.63 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  35.07 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  30.42 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  45.93 
 
 
264 aa  112  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  35.07 
 
 
273 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  52.34 
 
 
272 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  46.38 
 
 
263 aa  112  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  44.08 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  46.77 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  48.15 
 
 
267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  45.57 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  47.83 
 
 
280 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  48.84 
 
 
276 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  36.11 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 
271 aa  109  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  31.95 
 
 
281 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  32.59 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  30.85 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  30.85 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  30.85 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  33.97 
 
 
288 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  49.61 
 
 
273 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  50.42 
 
 
271 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  43.07 
 
 
280 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 
233 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  32.37 
 
 
285 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  34.04 
 
 
280 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
268 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  48.33 
 
 
264 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  29.03 
 
 
285 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  37.78 
 
 
307 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  44.14 
 
 
277 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  41.55 
 
 
282 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 
287 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  47.24 
 
 
275 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  35.94 
 
 
284 aa  105  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 
275 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 
205 aa  105  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
276 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
260 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
260 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
260 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  35.91 
 
 
272 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  34.01 
 
 
263 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  53.85 
 
 
287 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  30.91 
 
 
285 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 
269 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 
296 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  44.07 
 
 
265 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  46.34 
 
 
242 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  38.93 
 
 
282 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 
268 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
273 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  31.27 
 
 
263 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  40.83 
 
 
208 aa  103  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  36.08 
 
 
271 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 
274 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
252 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1374  phosphatidate cytidylyltransferase  48.48 
 
 
248 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.19741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>