More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1854 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
280 aa  532  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  80 
 
 
280 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  59.93 
 
 
282 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  57.45 
 
 
282 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  64.18 
 
 
282 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  56.74 
 
 
282 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  55.2 
 
 
289 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  41.85 
 
 
296 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  42.23 
 
 
280 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  41.79 
 
 
276 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 
276 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  41.44 
 
 
270 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
277 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  41.44 
 
 
278 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
270 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  42.38 
 
 
285 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  42.59 
 
 
270 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  39.48 
 
 
300 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  44.66 
 
 
268 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  38.63 
 
 
286 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  49.38 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  36.9 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  47.56 
 
 
286 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  47.56 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 
268 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
273 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  35.27 
 
 
288 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  38.11 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  35.83 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  44.67 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  44.67 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  35.82 
 
 
280 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  52.9 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  49.19 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  38.59 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  52.71 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  52.31 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  48.55 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  34.98 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  34.14 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  47.66 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  50.39 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  35.42 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  52.87 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  40.23 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 
264 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  42.67 
 
 
285 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  45.93 
 
 
263 aa  109  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  42.54 
 
 
264 aa  109  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  42 
 
 
285 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  52.1 
 
 
265 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  32.53 
 
 
283 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  41.33 
 
 
254 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 
273 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  50.83 
 
 
278 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  33.96 
 
 
263 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  33.59 
 
 
277 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  48.41 
 
 
268 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  40.15 
 
 
282 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  33.96 
 
 
263 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  32.86 
 
 
285 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  32.86 
 
 
285 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  33.89 
 
 
211 aa  105  6e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  33.96 
 
 
263 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  32.86 
 
 
285 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  32.86 
 
 
285 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  32.86 
 
 
285 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  33.96 
 
 
263 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  33.93 
 
 
285 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 
261 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  40.67 
 
 
285 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  40.67 
 
 
285 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  42.67 
 
 
285 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  32.93 
 
 
261 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  48.03 
 
 
274 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  40.67 
 
 
285 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
262 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  42.03 
 
 
296 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 
285 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  49.21 
 
 
271 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.04 
 
 
280 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 
271 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  33.71 
 
 
263 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  33.71 
 
 
263 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  33.71 
 
 
263 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  43.51 
 
 
265 aa  103  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  32.95 
 
 
351 aa  103  4e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  47.97 
 
 
271 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  33.71 
 
 
265 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  32.54 
 
 
265 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  42.95 
 
 
255 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
260 aa  102  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
269 aa  102  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  34.94 
 
 
276 aa  102  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  44.88 
 
 
252 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  32.5 
 
 
285 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>