More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3429 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  100 
 
 
282 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  100 
 
 
282 aa  558  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  100 
 
 
282 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  84.04 
 
 
282 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  74.82 
 
 
285 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  76.95 
 
 
285 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  76.95 
 
 
285 aa  424  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  73.4 
 
 
285 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  76.95 
 
 
285 aa  424  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  76.95 
 
 
285 aa  424  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  76.95 
 
 
285 aa  424  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  76.95 
 
 
285 aa  424  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  76.95 
 
 
285 aa  424  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  76.95 
 
 
285 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  76.95 
 
 
285 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  76.95 
 
 
285 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  76.95 
 
 
285 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  76.95 
 
 
285 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  76.95 
 
 
285 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  77.3 
 
 
285 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  77.66 
 
 
285 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  76.6 
 
 
285 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  75.2 
 
 
249 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  59.93 
 
 
284 aa  323  2e-87  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  45.36 
 
 
280 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  47.67 
 
 
268 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  43.34 
 
 
287 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  47.86 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  45.26 
 
 
283 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  46.95 
 
 
271 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 
285 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  44.01 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  45.1 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  46.13 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  46.95 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  46.32 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  45.88 
 
 
271 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  43.86 
 
 
285 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 
287 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  44.76 
 
 
285 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 
256 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  47 
 
 
285 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  43.82 
 
 
285 aa  208  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  45.16 
 
 
271 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  46.1 
 
 
285 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  46.1 
 
 
285 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  47.14 
 
 
271 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  43.26 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  45.74 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2422  phosphatidate cytidylyltransferase  46.5 
 
 
279 aa  198  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522142  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  47.52 
 
 
271 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  47.52 
 
 
271 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  46.1 
 
 
285 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  46.45 
 
 
271 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 
271 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  45.74 
 
 
290 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  41.84 
 
 
287 aa  191  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  45.29 
 
 
274 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 
254 aa  186  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 
261 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  43.01 
 
 
267 aa  175  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  44.2 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  43.06 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  37.01 
 
 
267 aa  168  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  40.07 
 
 
272 aa  165  8e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  40.07 
 
 
268 aa  165  9e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 
328 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  38.65 
 
 
276 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0325  phosphatidate cytidylyltransferase  38.87 
 
 
284 aa  151  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  39.22 
 
 
284 aa  151  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  36.9 
 
 
276 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  52.15 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  37.37 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  42.05 
 
 
275 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  36.92 
 
 
265 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  46.45 
 
 
269 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  36.56 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  55.12 
 
 
275 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  46.45 
 
 
269 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  38.85 
 
 
273 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  37.78 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 
284 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 
272 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  34.56 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  38.6 
 
 
284 aa  132  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  37.59 
 
 
271 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  37.59 
 
 
271 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  46.04 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0790  phosphatidate cytidylyltransferase  35.54 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.203528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  50.39 
 
 
280 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  37.29 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
260 aa  125  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
260 aa  125  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  48.8 
 
 
265 aa  124  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  36.39 
 
 
273 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  35.79 
 
 
281 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>