More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1591 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
268 aa  508  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  38.99 
 
 
280 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  42.38 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
277 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  40.08 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  39.53 
 
 
280 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 
276 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  40.86 
 
 
276 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  40.23 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  50.34 
 
 
289 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  55.8 
 
 
268 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
282 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  38.6 
 
 
216 aa  122  6e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  49.69 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  50.36 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  50.3 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  52.82 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  35.94 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  32.98 
 
 
282 aa  119  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  37.02 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  49.11 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  48.15 
 
 
205 aa  116  5e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  52.24 
 
 
221 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  37.2 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  33.89 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  34.02 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  36.25 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.14 
 
 
285 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  34.32 
 
 
264 aa  113  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  39.31 
 
 
270 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  39.31 
 
 
278 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  43.06 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  34.77 
 
 
282 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  36.65 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  33.92 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  33.92 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  33.92 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  33.92 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  32.75 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  33.92 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  33.1 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.1 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  49.66 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  33.1 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  48.84 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  33.1 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  45.81 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  33.1 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  33.1 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  31.79 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  31.79 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  31.79 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  37.88 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  41.56 
 
 
264 aa  109  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  39.23 
 
 
286 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  48.72 
 
 
259 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  53.66 
 
 
270 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  41.45 
 
 
249 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  50.38 
 
 
260 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  30.27 
 
 
280 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  35.21 
 
 
281 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  34.88 
 
 
256 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  38.28 
 
 
286 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
307 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  41.45 
 
 
285 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 
294 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  39.64 
 
 
267 aa  106  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 
294 aa  105  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  32.07 
 
 
287 aa  105  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 
208 aa  105  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 
269 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 
261 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  29.96 
 
 
264 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
341 aa  103  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 
274 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  45.04 
 
 
285 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  38.98 
 
 
270 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  36.92 
 
 
268 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 
265 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  44.12 
 
 
285 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  32.41 
 
 
280 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 
265 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  50.39 
 
 
265 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  29.73 
 
 
287 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  35.04 
 
 
271 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  32.84 
 
 
276 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  35.51 
 
 
276 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  37.45 
 
 
267 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  53.27 
 
 
263 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 
264 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 
268 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  41.79 
 
 
284 aa  100  3e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  35.11 
 
 
279 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  32.95 
 
 
263 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  31.94 
 
 
274 aa  99  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>