More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2852 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
282 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  88.3 
 
 
282 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  74.82 
 
 
282 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  65.96 
 
 
282 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  60.28 
 
 
280 aa  290  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  57.45 
 
 
280 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  59.14 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  38.29 
 
 
280 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  41.74 
 
 
277 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  35.74 
 
 
296 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  42.18 
 
 
286 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
270 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  39.18 
 
 
276 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 
286 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 
276 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  40.51 
 
 
286 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  40.08 
 
 
268 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  39.33 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  38.62 
 
 
278 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  38.62 
 
 
270 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  49.68 
 
 
273 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  49.68 
 
 
273 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
294 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  52.99 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  38.76 
 
 
268 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  30.94 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  56.25 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  37.22 
 
 
281 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  52.07 
 
 
264 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  36.57 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.86 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  46.15 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  42.48 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  36.1 
 
 
280 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.09 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.12 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  49.64 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  38.19 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  45.74 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  51.69 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  51.69 
 
 
271 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  52.59 
 
 
264 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  49.65 
 
 
229 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  49.68 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  49.14 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  52.73 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  48.82 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  32.67 
 
 
216 aa  108  9.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  36.78 
 
 
268 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  51.69 
 
 
271 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  49.61 
 
 
285 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  44.76 
 
 
287 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  50.85 
 
 
282 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 
270 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  50.85 
 
 
282 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  50.85 
 
 
282 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  44.8 
 
 
264 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
254 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  35.34 
 
 
265 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  35.56 
 
 
294 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  45.97 
 
 
260 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  34.62 
 
 
261 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  54.9 
 
 
268 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 
285 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  42.22 
 
 
263 aa  106  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
285 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
266 aa  106  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  43.55 
 
 
282 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 
271 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  47.58 
 
 
260 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  47.58 
 
 
260 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  47.33 
 
 
285 aa  105  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  48.31 
 
 
285 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  48.31 
 
 
285 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  48.31 
 
 
285 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  48.31 
 
 
285 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  48.31 
 
 
285 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  49.15 
 
 
282 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 
273 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  44.76 
 
 
285 aa  105  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  48.31 
 
 
285 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  48.31 
 
 
285 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  48.31 
 
 
285 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  48.31 
 
 
285 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  48.31 
 
 
285 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
285 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  48.31 
 
 
285 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  44.76 
 
 
285 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  48.31 
 
 
285 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  48.31 
 
 
249 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 
261 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  45 
 
 
267 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
263 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  44.25 
 
 
283 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 
285 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>