More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3445 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 285 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  60.36 
 
 		 286 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  59.42 
 
 		 286 aa  268  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  58.7 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  55.34 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  53.73 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  45.18 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  39.78 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  42.32 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  40.73 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  40.07 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  41.57 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  42.55 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  38.6 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  39.78 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  39.41 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  40.08 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  43.25 
 
 		 270 aa  132  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  43.82 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  42.08 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  48.39 
 
 		 289 aa  128  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  36.96 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  39.53 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  37.11 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  47.69 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  50.36 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  36 
 
 		 221 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  54.48 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  46.09 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.98 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  30.22 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  48.67 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  31.91 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  47.46 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  42.6 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  46.77 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  30.22 
 
 		 263 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  29.85 
 
 		 263 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  29.85 
 
 		 263 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.47 
 
 		 264 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  45.13 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  44.85 
 
 		 270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  47.83 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  40.44 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  40.44 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  29.56 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  29.56 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  29.56 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  46.58 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  29.56 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.88 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  30.16 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  48.18 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  41.98 
 
 		 208 aa  106  6e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  34.04 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  44.27 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  34.04 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  50.42 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 		 205 aa  105  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  39.48 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  32.56 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  48.09 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  44.97 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  35.68 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  50.86 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  44.2 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  51.49 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  31.73 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  45.32 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  48.44 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  38.28 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  50.89 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  39.08 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 270 aa  99.8  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  44.03 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  40.23 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  34.83 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  31.38 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  45.6 
 
 		 265 aa  99  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 281 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  31.66 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.77 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>