More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1496 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
263 aa  502  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  50.38 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  47.47 
 
 
273 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  47.08 
 
 
273 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
265 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  41.02 
 
 
283 aa  155  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3996  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
284 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428683  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  35.82 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  52.99 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
300 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  53.54 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
276 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  56.76 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  49.62 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  51.15 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  34.93 
 
 
296 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  37.19 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  39.53 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  47.79 
 
 
294 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  38.71 
 
 
268 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  38.12 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  35.06 
 
 
294 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 
285 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  39.05 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 
285 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 
285 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 
285 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 
285 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 
285 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  34.08 
 
 
276 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
286 aa  105  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
286 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  38.12 
 
 
249 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  38.67 
 
 
285 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  44.65 
 
 
281 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  35.09 
 
 
288 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  34.02 
 
 
221 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  48.46 
 
 
289 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  49.62 
 
 
286 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  34.51 
 
 
267 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  31.75 
 
 
287 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  32.32 
 
 
272 aa  102  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 
277 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  45.19 
 
 
285 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 
285 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  42.03 
 
 
254 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  40.56 
 
 
265 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 
285 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  41.36 
 
 
282 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  32.77 
 
 
242 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  40.34 
 
 
281 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  45.81 
 
 
268 aa  99  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
264 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  35.1 
 
 
260 aa  99  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  35.1 
 
 
260 aa  99  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  41.22 
 
 
282 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  41.22 
 
 
282 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  41.22 
 
 
282 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  37.09 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  32.56 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  36.3 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  34.2 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  36.2 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  42.07 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  42.24 
 
 
284 aa  96.7  3e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  42.03 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.96 
 
 
205 aa  96.7  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.6 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  46.02 
 
 
264 aa  95.9  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  41.07 
 
 
285 aa  95.5  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  43.07 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  41.74 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  38.13 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  38.85 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  30.28 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1374  phosphatidate cytidylyltransferase  31.99 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.19741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  42.15 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  45.08 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  38.85 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000797314  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  30.89 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  46.36 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.17 
 
 
211 aa  93.2  4e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  35.07 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  42.37 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  40.8 
 
 
216 aa  92.4  6e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  39.86 
 
 
291 aa  92.4  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
229 aa  92.4  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  47.37 
 
 
287 aa  92  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>