More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2434 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
267 aa  519  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  56.13 
 
 
264 aa  280  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  55.22 
 
 
264 aa  271  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 
263 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
263 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.39 
 
 
264 aa  201  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  42.91 
 
 
264 aa  199  5e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 
263 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  44.4 
 
 
263 aa  195  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  44.4 
 
 
263 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  44.4 
 
 
263 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 
263 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 
263 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 
263 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  44.74 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  42.26 
 
 
260 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  39.33 
 
 
260 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  43.46 
 
 
255 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39.33 
 
 
260 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  42.01 
 
 
265 aa  172  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  39.55 
 
 
263 aa  169  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
264 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
260 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  31.6 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  33.09 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  34.93 
 
 
285 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  33.92 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  33.56 
 
 
285 aa  109  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  34.14 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  33.92 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  41.61 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
268 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  45.8 
 
 
256 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 
285 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  29.68 
 
 
301 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  44.27 
 
 
280 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  40.72 
 
 
258 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  38.65 
 
 
262 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
267 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
264 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  33.79 
 
 
285 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  31.97 
 
 
261 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  30.91 
 
 
277 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  33.79 
 
 
285 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  34.98 
 
 
252 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  46.62 
 
 
285 aa  105  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  32 
 
 
269 aa  105  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  36.13 
 
 
294 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  44.85 
 
 
296 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  40.83 
 
 
242 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  36.51 
 
 
279 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
269 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 
280 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
288 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  28.42 
 
 
285 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 
270 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
285 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 
269 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
285 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  41.98 
 
 
272 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 
273 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  33.56 
 
 
285 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  41.96 
 
 
254 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09871  phosphatidate cytidylyltransferase  31.83 
 
 
304 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  34.35 
 
 
285 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  44.2 
 
 
269 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  43.94 
 
 
285 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  32.31 
 
 
280 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 
285 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2591  phosphatidate cytidylyltransferase  28.33 
 
 
301 aa  99.8  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.163491  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  35.86 
 
 
211 aa  99.8  4e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  36.9 
 
 
229 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  42.55 
 
 
290 aa  99.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
278 aa  99.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 
282 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  39.19 
 
 
275 aa  99.4  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  29.47 
 
 
280 aa  99  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  29.75 
 
 
271 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  33.21 
 
 
280 aa  98.6  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
296 aa  98.6  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 
309 aa  98.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 
309 aa  98.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 
309 aa  98.6  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  40.85 
 
 
280 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  37.59 
 
 
286 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  42.19 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  36.53 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  31.05 
 
 
332 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  41.35 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  41.32 
 
 
216 aa  97.1  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>