More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1667 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
264 aa  518  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  98.86 
 
 
267 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 
278 aa  188  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  37.59 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 
259 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
269 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  36.64 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  42.68 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  37.26 
 
 
264 aa  135  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  33.68 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  43.9 
 
 
265 aa  133  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  36.36 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  34.82 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.09 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  35.54 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
264 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  37.88 
 
 
261 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  34.62 
 
 
269 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  33.59 
 
 
263 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 
242 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  35.04 
 
 
279 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  40.7 
 
 
260 aa  122  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  28.09 
 
 
307 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  36.47 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  33.72 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  42.51 
 
 
259 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  39.22 
 
 
254 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  39.87 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  36.11 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  36.11 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  39.06 
 
 
280 aa  116  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  39.87 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  45.53 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  32.32 
 
 
261 aa  115  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  38.12 
 
 
267 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  31.13 
 
 
280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  32.69 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1424  phosphatidate cytidylyltransferase  33.08 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.521758  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  38.41 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  38.61 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  32.81 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  40.11 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  39.75 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  33.07 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  31.56 
 
 
264 aa  113  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  37.72 
 
 
286 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  37.65 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  30.83 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 
288 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
281 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
208 aa  112  7.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  32.44 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  41.21 
 
 
341 aa  112  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  30.04 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  32.69 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  32.69 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  32.69 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  32.69 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  35.8 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  32.78 
 
 
306 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
211 aa  110  3e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  37.18 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 
342 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  32.93 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  33.75 
 
 
318 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  33.16 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  48.67 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  45.6 
 
 
280 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  41.5 
 
 
276 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  31.6 
 
 
281 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  33.9 
 
 
236 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 
296 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  30.85 
 
 
290 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
280 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  29.41 
 
 
293 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  42.06 
 
 
279 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 
272 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  38.12 
 
 
267 aa  105  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  30.67 
 
 
264 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  30.74 
 
 
289 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 
256 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
306 aa  105  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
280 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  29.73 
 
 
293 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  38.85 
 
 
216 aa  105  9e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  38.32 
 
 
262 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  34.25 
 
 
266 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  45.39 
 
 
282 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  36.45 
 
 
310 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  45.39 
 
 
282 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  43.61 
 
 
285 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>