More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23590 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  100 
 
 
280 aa  553  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  59.93 
 
 
310 aa  340  1e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  53.45 
 
 
303 aa  296  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  39.61 
 
 
341 aa  198  9e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  45.22 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  39.65 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.65 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  35.19 
 
 
281 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  34.23 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 
267 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 
264 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  33.72 
 
 
281 aa  116  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  35.96 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  38.37 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 
242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  37.72 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  42.03 
 
 
285 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 
267 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  41.67 
 
 
285 aa  112  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  42.03 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  43.88 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  46.43 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  46.43 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  46.43 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  46.43 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  46.43 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  46.43 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  46.43 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  46.43 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  44.36 
 
 
282 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  44.36 
 
 
282 aa  109  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  44.36 
 
 
282 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  44.29 
 
 
285 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  44.29 
 
 
285 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.29 
 
 
285 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.29 
 
 
285 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  40.51 
 
 
293 aa  109  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  44.29 
 
 
285 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  40.83 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  46.36 
 
 
246 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
280 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  47.5 
 
 
284 aa  108  1e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 
277 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  29.45 
 
 
281 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  44.63 
 
 
270 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  33.72 
 
 
270 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  45.97 
 
 
260 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 
233 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  30.94 
 
 
270 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  46.28 
 
 
264 aa  106  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  30.58 
 
 
290 aa  106  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  34.33 
 
 
277 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  48.8 
 
 
269 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 
342 aa  105  8e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
260 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
260 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  31.43 
 
 
284 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 
287 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  31.82 
 
 
296 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  32.34 
 
 
259 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
285 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  38.65 
 
 
275 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  35.47 
 
 
348 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 
295 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.2 
 
 
260 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  41.33 
 
 
285 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  32.04 
 
 
282 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
271 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 
295 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  46.02 
 
 
278 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  45.93 
 
 
271 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  30.07 
 
 
270 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  45.93 
 
 
271 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  32.48 
 
 
281 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 
268 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  46.77 
 
 
276 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  31.34 
 
 
263 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
368 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  47.15 
 
 
292 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 
285 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  34.83 
 
 
260 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  39.49 
 
 
271 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  31.34 
 
 
307 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  43.08 
 
 
280 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
285 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  30.23 
 
 
263 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  39.33 
 
 
285 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 
306 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
271 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1500  phosphatidate cytidylyltransferase  29.37 
 
 
285 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  47.97 
 
 
441 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
287 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  44.74 
 
 
283 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>