More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0485 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  44.69 
 
 
233 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  37.23 
 
 
279 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  48.52 
 
 
262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  34.04 
 
 
267 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  33.68 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  38.05 
 
 
281 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  39.02 
 
 
281 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.05 
 
 
281 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  39.34 
 
 
282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
275 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  34.13 
 
 
278 aa  123  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  36.82 
 
 
258 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  42.68 
 
 
264 aa  122  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.38 
 
 
264 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  42.77 
 
 
260 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  43.87 
 
 
246 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  42.04 
 
 
260 aa  119  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  32.59 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  44.71 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1490  phosphatidate cytidylyltransferase  44.12 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1255  phosphatidate cytidylyltransferase  45.56 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00219294  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  33.22 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  37.13 
 
 
236 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 
270 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
307 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.66 
 
 
279 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
264 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  37.16 
 
 
267 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2751  phosphatidate cytidylyltransferase  40.76 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  39.44 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  40.85 
 
 
271 aa  113  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  39.07 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  40.12 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  39.02 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  30.36 
 
 
259 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  36.04 
 
 
267 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  39.53 
 
 
264 aa  112  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  41.21 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  36.07 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  39.77 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 
261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  40.33 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  39.76 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39.76 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  30.74 
 
 
281 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
287 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  29.58 
 
 
270 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 
268 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 
284 aa  109  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  45.71 
 
 
276 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.12 
 
 
205 aa  109  6e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
263 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
263 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  29.23 
 
 
270 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  38.59 
 
 
272 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  41.18 
 
 
263 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 
275 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
265 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  39.18 
 
 
284 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
255 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  34.4 
 
 
303 aa  107  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3728  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 
248 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 
271 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  38.51 
 
 
265 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  38.57 
 
 
211 aa  106  6e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  42.08 
 
 
283 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 
268 aa  105  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 
273 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 
272 aa  105  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  44.09 
 
 
254 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  37.84 
 
 
265 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 
273 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
268 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  44.96 
 
 
274 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  47.29 
 
 
278 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 
285 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  29.93 
 
 
277 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  44.85 
 
 
267 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
269 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  40.37 
 
 
274 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
266 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  37.57 
 
 
339 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  37.95 
 
 
273 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
273 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  38.36 
 
 
256 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  44.09 
 
 
285 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  34.2 
 
 
267 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  35.05 
 
 
306 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>