More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1255 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1255  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
262 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00219294  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  64.38 
 
 
233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3728  phosphatidate cytidylyltransferase  61.32 
 
 
248 aa  241  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2751  phosphatidate cytidylyltransferase  60.89 
 
 
255 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  51.56 
 
 
252 aa  235  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1490  phosphatidate cytidylyltransferase  60.48 
 
 
255 aa  234  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  50.59 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  52.17 
 
 
236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  46.99 
 
 
296 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  44.51 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  38.71 
 
 
274 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  35.68 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  35.95 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  38.83 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  46.62 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  48.85 
 
 
279 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  35.12 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  41.36 
 
 
281 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
260 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 
263 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  40.45 
 
 
282 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  46.46 
 
 
263 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  41.01 
 
 
280 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  42.21 
 
 
265 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  42.21 
 
 
263 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  42.21 
 
 
263 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  42.21 
 
 
263 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  48.03 
 
 
263 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.47 
 
 
281 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  41.4 
 
 
279 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.77 
 
 
242 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  48.03 
 
 
263 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  48.82 
 
 
255 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  48.03 
 
 
263 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  38.95 
 
 
281 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  37.04 
 
 
275 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  35.91 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 
258 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  39.75 
 
 
271 aa  119  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  44.23 
 
 
262 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.13 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  39.39 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  38.5 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  34.02 
 
 
260 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  41.14 
 
 
260 aa  116  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  34.02 
 
 
260 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  52.9 
 
 
270 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  35.51 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  38.79 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  39.88 
 
 
271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  44.94 
 
 
266 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  44.08 
 
 
254 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  36.65 
 
 
288 aa  112  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  34.25 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  34.18 
 
 
288 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  41.71 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  34.58 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  45.76 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  49.61 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  34.44 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  35.02 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  41.33 
 
 
273 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
269 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  40.85 
 
 
267 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 
246 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  48.48 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1045  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.447083  normal  0.0440857 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  28.72 
 
 
306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 
286 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  33.47 
 
 
264 aa  109  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  39.72 
 
 
242 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3512  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 
336 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0503603  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  41.29 
 
 
280 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 
275 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  40.61 
 
 
261 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  41.36 
 
 
303 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  37.69 
 
 
306 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
475 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
267 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  34.6 
 
 
301 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 
322 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  41.76 
 
 
341 aa  106  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  45.76 
 
 
264 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  36.78 
 
 
313 aa  105  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  39.25 
 
 
295 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  34.98 
 
 
271 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  39.35 
 
 
277 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 
271 aa  104  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  40.32 
 
 
310 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1424  phosphatidate cytidylyltransferase  41.76 
 
 
264 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.521758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  35.39 
 
 
271 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  34.66 
 
 
205 aa  104  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  36.51 
 
 
270 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  32.45 
 
 
306 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>