More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0391 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 273 aa  531  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  69.85 
 
 		 274 aa  350  1e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  71.79 
 
 		 284 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  64.31 
 
 		 273 aa  330  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  67.78 
 
 		 271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  55.3 
 
 		 281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  52.69 
 
 		 277 aa  267  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  33.69 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  36 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  34.08 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  33.84 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  34.83 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  37.55 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  34.95 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  32.06 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  32.93 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  32.93 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  30.4 
 
 		 271 aa  118  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  31.11 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  32.13 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  36.07 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  27.21 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  31.01 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.8 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  31.48 
 
 		 263 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  26.82 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  32.84 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  32.04 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  48.46 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  48.46 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.21 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  31.48 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  31.48 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  33.61 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  31.6 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  31.48 
 
 		 263 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  44.81 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  30.29 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  50.86 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  33.79 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  33.72 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  50.86 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  30.48 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  31.36 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  48.48 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  34.6 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  31.6 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  31.6 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  31.6 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  31.6 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.14 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  33.1 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  31.17 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  31.8 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  29.58 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  29.33 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  33.22 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  39.63 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  33.84 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0708389 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  38.12 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  46.22 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  41.4 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  46.22 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  47.86 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  30.71 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  38.85 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  29.77 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  41.56 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.56 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 		 310 aa  99.4  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  41.67 
 
 		 216 aa  99.4  5e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  41.56 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  41.56 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  40.54 
 
 		 287 aa  99.4  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  41.56 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>