More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1045 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1045  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
276 aa  539  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.447083  normal  0.0440857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  43.88 
 
 
286 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  45.26 
 
 
275 aa  195  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  35.03 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  32.71 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  34.96 
 
 
260 aa  125  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  31.21 
 
 
278 aa  125  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  34.18 
 
 
267 aa  125  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  34.18 
 
 
267 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  32.86 
 
 
279 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  33.82 
 
 
267 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.25 
 
 
261 aa  122  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.31 
 
 
264 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  34.27 
 
 
280 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  48.03 
 
 
274 aa  118  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  45.57 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  46.45 
 
 
233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  35.21 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  35.21 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  35.21 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  31.41 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  37.23 
 
 
306 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  31.65 
 
 
290 aa  112  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  36.3 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  30.11 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  32.08 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 
285 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  46.25 
 
 
236 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  37.97 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  37.97 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  37.97 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  37.97 
 
 
249 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  37.97 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  37.97 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  37.97 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  41.24 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  37.97 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3512  phosphatidate cytidylyltransferase  41.28 
 
 
336 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0503603  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
264 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  40.37 
 
 
252 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  36.87 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  36.87 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  36.87 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  34.21 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  36.87 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  36.87 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  40.96 
 
 
280 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
272 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  36.9 
 
 
285 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 
285 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  31.85 
 
 
263 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  38.34 
 
 
285 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  30.51 
 
 
332 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  32.34 
 
 
259 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  37.85 
 
 
285 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  37.95 
 
 
284 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  49.56 
 
 
271 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  37.36 
 
 
285 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  38.61 
 
 
260 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  36.25 
 
 
280 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  36.89 
 
 
242 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  38.86 
 
 
285 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 
263 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 
263 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  28.78 
 
 
277 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  41.57 
 
 
282 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 
263 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  38.29 
 
 
296 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
262 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 
273 aa  105  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  37.7 
 
 
281 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  32.13 
 
 
303 aa  104  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  38.07 
 
 
285 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  30.8 
 
 
269 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39.33 
 
 
272 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  42.14 
 
 
285 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  40.76 
 
 
283 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  39.22 
 
 
268 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  35.85 
 
 
275 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  51.35 
 
 
275 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.56 
 
 
368 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 
266 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  30.45 
 
 
264 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  40.99 
 
 
290 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
285 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  29.96 
 
 
277 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
285 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
287 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
269 aa  103  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  46.97 
 
 
260 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  43.66 
 
 
270 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  39.22 
 
 
271 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  31.34 
 
 
263 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  31.34 
 
 
263 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  48.67 
 
 
271 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  31.34 
 
 
263 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  32.84 
 
 
261 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>