More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1347 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
272 aa  513  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  94.12 
 
 
272 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  82.95 
 
 
271 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  62.87 
 
 
273 aa  291  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  62.87 
 
 
273 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1916  phosphatidate cytidylyltransferase  52.75 
 
 
273 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5324  phosphatidate cytidylyltransferase  51.97 
 
 
273 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0966585  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  53.05 
 
 
273 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2047  phosphatidate cytidylyltransferase  53.11 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6063  phosphatidate cytidylyltransferase  53.05 
 
 
273 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  53.05 
 
 
273 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1262  phosphatidate cytidylyltransferase  49.63 
 
 
273 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1687  putative phosphatidate cytidylyltransferase  51.46 
 
 
273 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426329  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  50.36 
 
 
273 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2450  phosphatidate cytidylyltransferase  51.28 
 
 
273 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166236 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  47.27 
 
 
275 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2032  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  43.82 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  45.26 
 
 
275 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  41.34 
 
 
281 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1550  phosphatidate cytidylyltransferase  48.54 
 
 
273 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2432  phosphatidate cytidylyltransferase  48.54 
 
 
273 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0787111  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2578  phosphatidate cytidylyltransferase  48.54 
 
 
273 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2488  phosphatidate cytidylyltransferase  48.54 
 
 
273 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1323  phosphatidate cytidylyltransferase  48.54 
 
 
273 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.077571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3260  phosphatidate cytidylyltransferase  48.54 
 
 
273 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0696258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2051  phosphatidate cytidylyltransferase  48.54 
 
 
273 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  44.77 
 
 
276 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0708389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  45.39 
 
 
284 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 
281 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  35.05 
 
 
287 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  39.78 
 
 
268 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.01 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  40.22 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  45.39 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
271 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  42.97 
 
 
279 aa  142  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  40.21 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  35.86 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  38.19 
 
 
282 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  35.4 
 
 
285 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  38.19 
 
 
282 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  38.19 
 
 
282 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  35.77 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  37.29 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1828  phosphatidate cytidylyltransferase  42.65 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 
271 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  35.74 
 
 
285 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  39.49 
 
 
271 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  36.95 
 
 
285 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  40.22 
 
 
271 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  37.77 
 
 
271 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  36.61 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.61 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  36.61 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  36.61 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  36.61 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  36.61 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  36.61 
 
 
285 aa  135  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
271 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.02 
 
 
285 aa  135  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  36.43 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  36.43 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  36.43 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  36.43 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  36.43 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  36.69 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 
285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.51 
 
 
281 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  35.33 
 
 
285 aa  131  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  35.56 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  48.77 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  38.79 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  36.86 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4943  phosphatidate cytidylyltransferase  44.48 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  37.2 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  32.34 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  34.85 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  34.89 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  32.87 
 
 
287 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  35.81 
 
 
285 aa  126  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0790  phosphatidate cytidylyltransferase  37.72 
 
 
268 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.203528 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  37.19 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  33.56 
 
 
287 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  47.2 
 
 
269 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  53.9 
 
 
267 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  34.47 
 
 
285 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  47.2 
 
 
269 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1443  phosphatidate cytidylyltransferase  40.21 
 
 
283 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  33.1 
 
 
284 aa  122  6e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  31.6 
 
 
265 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  33.81 
 
 
268 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  33.81 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  38.71 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  36.22 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  50.33 
 
 
277 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  47.48 
 
 
283 aa  118  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>