More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0887 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 261 aa  501  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  40.23 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  34.6 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  36.19 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  38.43 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  39.08 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39.08 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  38.87 
 
 		 712 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  32.37 
 
 		 278 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  34.42 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  38.52 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.71 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  32.18 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  32.7 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  32.7 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  36.16 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  36.7 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  33.83 
 
 		 269 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  34.77 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.03 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  31.92 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  42.94 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  34.89 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  35.66 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  31.56 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  34.43 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  34.93 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  31.09 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  29.17 
 
 		 290 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  32.56 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  37.87 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  34.85 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  34.1 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  35.06 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  30.92 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  31.05 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  37.87 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  39.25 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  31.82 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  28.38 
 
 		 306 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  33.45 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  33.73 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  39.19 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  31.85 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  30.83 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  30.45 
 
 		 332 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  42.77 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  31.97 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  35.32 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  38.3 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  31.97 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  31.97 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  45.9 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  45.9 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  44.26 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  45.9 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  32.43 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  37.23 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  33.85 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.51 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  33.83 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  30.6 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  41.8 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  41.8 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.8 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.8 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  41.8 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  31.46 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  40.51 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  32.52 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  33.59 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  32.81 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  32.59 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  30.82 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  31.23 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  32.85 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  40.16 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  30.19 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  30.85 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  40.16 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  38.79 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  40.16 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  40.83 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  40.16 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  40.16 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  40.16 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  40.16 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  35.89 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.509616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>