More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_11751 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
285 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  80 
 
 
285 aa  464  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  81.05 
 
 
285 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  80 
 
 
285 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  58.51 
 
 
295 aa  332  3e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  58.51 
 
 
295 aa  332  3e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09871  phosphatidate cytidylyltransferase  54.93 
 
 
304 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  53.55 
 
 
301 aa  291  8e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  55.16 
 
 
294 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  53.03 
 
 
288 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  45.02 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  42.51 
 
 
293 aa  219  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  44.67 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
288 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
295 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
295 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  41.75 
 
 
304 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  44.66 
 
 
293 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  34.47 
 
 
364 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  32.99 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  32.29 
 
 
267 aa  132  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47250  predicted protein  30.52 
 
 
574 aa  132  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110596  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  33.1 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  31.91 
 
 
280 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  48.28 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  34.23 
 
 
256 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
263 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 
242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  33.07 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  35.83 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  39.2 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  46.48 
 
 
266 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  40.78 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  34.38 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  33.33 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 
263 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  45.76 
 
 
271 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
264 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  37.57 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.27 
 
 
211 aa  109  5e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  47.75 
 
 
241 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  30.57 
 
 
278 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  30.43 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  30.43 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  40.76 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  38.92 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  31.23 
 
 
269 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  47.71 
 
 
241 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
241 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  49.58 
 
 
285 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
298 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  31.69 
 
 
255 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 
253 aa  107  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 
254 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.11 
 
 
368 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  35.56 
 
 
268 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  30.55 
 
 
261 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
298 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 
274 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  36.76 
 
 
285 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  39.9 
 
 
283 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  42.47 
 
 
286 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 
285 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
270 aa  106  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  46.27 
 
 
282 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  44.27 
 
 
289 aa  105  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 
285 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 
285 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  34.45 
 
 
280 aa  105  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  45.83 
 
 
298 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
254 aa  105  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 
271 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  29.15 
 
 
307 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
254 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  51.35 
 
 
275 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  47.41 
 
 
298 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
298 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 
260 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
298 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  46.83 
 
 
216 aa  103  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  41.4 
 
 
285 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  46.4 
 
 
282 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
285 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  46.4 
 
 
282 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
298 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  47.41 
 
 
298 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  46.4 
 
 
282 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  35.9 
 
 
276 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  43.2 
 
 
260 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.76 
 
 
475 aa  103  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  43.2 
 
 
260 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  47.27 
 
 
269 aa  103  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>